Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVD6

Vmn1r195, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r195Q5SVD6 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vmn1r195Q5SVD6 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vmn1r195Q5SVD6 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vmn1r195Q5SVD6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vmn1r195Q5SVD6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vmn1r195Q5SVD6 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vmn1r195Q5SVD6 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vmn1r195Q5SVD6 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vmn1r195Q5SVD6 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vmn1r195Q5SVD6 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vmn1r195Q5SVD6 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vmn1r195Q5SVD6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vmn1r195Q5SVD6 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vmn1r195Q5SVD6 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vmn1r195Q5SVD6 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vmn1r195Q5SVD6 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vmn1r195Q5SVD6 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vmn1r195Q5SVD6 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vmn1r195Q5SVD6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vmn1r195Q5SVD6 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Vmn1r195Q5SVD6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vmn1r195Q5SVD6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vmn1r195Q5SVD6 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vmn1r195Q5SVD6 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vmn1r195Q5SVD6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vmn1r195Q5SVD6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vmn1r195Q5SVD6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Vmn1r195Q5SVD6 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vmn1r195Q5SVD6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vmn1r195Q5SVD6 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vmn1r195Q5SVD6 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vmn1r195Q5SVD6 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vmn1r195Q5SVD6 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vmn1r195Q5SVD6 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vmn1r195Q5SVD6 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vmn1r195Q5SVD6 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vmn1r195Q5SVD6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vmn1r195Q5SVD6 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vmn1r195Q5SVD6 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vmn1r195Q5SVD6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vmn1r195Q5SVD6 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vmn1r195Q5SVD6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vmn1r195Q5SVD6 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vmn1r195Q5SVD6 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vmn1r195Q5SVD6 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vmn1r195Q5SVD6 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vmn1r195Q5SVD6 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vmn1r195Q5SVD6 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vmn1r195Q5SVD6 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vmn1r195Q5SVD6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vmn1r195Q5SVD6 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vmn1r195Q5SVD6 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vmn1r195Q5SVD6 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vmn1r195Q5SVD6 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Vmn1r195Q5SVD6 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vmn1r195Q5SVD6 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Vmn1r195Q5SVD6 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Vmn1r195Q5SVD6 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vmn1r195Q5SVD6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vmn1r195Q5SVD6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vmn1r195Q5SVD6 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vmn1r195Q5SVD6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vmn1r195Q5SVD6 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vmn1r195Q5SVD6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vmn1r195Q5SVD6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vmn1r195Q5SVD6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vmn1r195Q5SVD6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vmn1r195Q5SVD6 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vmn1r195Q5SVD6 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vmn1r195Q5SVD6 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vmn1r195Q5SVD6 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vmn1r195Q5SVD6 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vmn1r195Q5SVD6 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vmn1r195Q5SVD6 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vmn1r195Q5SVD6 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vmn1r195Q5SVD6 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vmn1r195Q5SVD6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vmn1r195Q5SVD6 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Vmn1r195Q5SVD6 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Vmn1r195Q5SVD6 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Vmn1r195Q5SVD6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vmn1r195Q5SVD6 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vmn1r195Q5SVD6 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vmn1r195Q5SVD6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vmn1r195Q5SVD6 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vmn1r195Q5SVD6 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vmn1r195Q5SVD6 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vmn1r195Q5SVD6 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vmn1r195Q5SVD6 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vmn1r195Q5SVD6 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vmn1r195Q5SVD6 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vmn1r195Q5SVD6 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vmn1r195Q5SVD6 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vmn1r195Q5SVD6 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vmn1r195Q5SVD6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vmn1r195Q5SVD6 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vmn1r195Q5SVD6 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vmn1r195Q5SVD6 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vmn1r195Q5SVD6 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vmn1r195Q5SVD6 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms