Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV66

Ccdc42, Coiled-coil domain-containing protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc42Q5SV66 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc42Q5SV66 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc42Q5SV66 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc42Q5SV66 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc42Q5SV66 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc42Q5SV66 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc42Q5SV66 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccdc42Q5SV66 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc42Q5SV66 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc42Q5SV66 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc42Q5SV66 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc42Q5SV66 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc42Q5SV66 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc42Q5SV66 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc42Q5SV66 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc42Q5SV66 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc42Q5SV66 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc42Q5SV66 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc42Q5SV66 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc42Q5SV66 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc42Q5SV66 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc42Q5SV66 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc42Q5SV66 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Ccdc42Q5SV66 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc42Q5SV66 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc42Q5SV66 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc42Q5SV66 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc42Q5SV66 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc42Q5SV66 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc42Q5SV66 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc42Q5SV66 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc42Q5SV66 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc42Q5SV66 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc42Q5SV66 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc42Q5SV66 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc42Q5SV66 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc42Q5SV66 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc42Q5SV66 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc42Q5SV66 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc42Q5SV66 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc42Q5SV66 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc42Q5SV66 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc42Q5SV66 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc42Q5SV66 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc42Q5SV66 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc42Q5SV66 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc42Q5SV66 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc42Q5SV66 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc42Q5SV66 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc42Q5SV66 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc42Q5SV66 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc42Q5SV66 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc42Q5SV66 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ccdc42Q5SV66 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ccdc42Q5SV66 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ccdc42Q5SV66 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc42Q5SV66 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc42Q5SV66 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc42Q5SV66 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc42Q5SV66 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc42Q5SV66 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc42Q5SV66 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc42Q5SV66 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc42Q5SV66 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc42Q5SV66 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc42Q5SV66 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc42Q5SV66 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc42Q5SV66 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc42Q5SV66 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc42Q5SV66 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc42Q5SV66 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc42Q5SV66 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc42Q5SV66 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc42Q5SV66 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc42Q5SV66 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc42Q5SV66 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc42Q5SV66 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc42Q5SV66 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc42Q5SV66 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc42Q5SV66 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc42Q5SV66 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc42Q5SV66 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc42Q5SV66 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc42Q5SV66 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc42Q5SV66 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc42Q5SV66 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc42Q5SV66 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc42Q5SV66 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc42Q5SV66 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc42Q5SV66 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc42Q5SV66 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc42Q5SV66 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc42Q5SV66 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc42Q5SV66 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc42Q5SV66 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc42Q5SV66 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Ccdc42Q5SV66 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc42Q5SV66 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc42Q5SV66 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc42Q5SV66 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.1 ms