Protein–RNA interactions for Protein: Q5SS00

Zdbf2, DBF4-type zinc finger-containing protein 2 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zdbf2Q5SS00 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Zdbf2Q5SS00 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
Zdbf2Q5SS00 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Zdbf2Q5SS00 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Zdbf2Q5SS00 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Zdbf2Q5SS00 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Zdbf2Q5SS00 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Zdbf2Q5SS00 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Zdbf2Q5SS00 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Zdbf2Q5SS00 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Zdbf2Q5SS00 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Zdbf2Q5SS00 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Zdbf2Q5SS00 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Zdbf2Q5SS00 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Zdbf2Q5SS00 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Zdbf2Q5SS00 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Zdbf2Q5SS00 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Zdbf2Q5SS00 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Zdbf2Q5SS00 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Zdbf2Q5SS00 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Zdbf2Q5SS00 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Zdbf2Q5SS00 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Zdbf2Q5SS00 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Zdbf2Q5SS00 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Zdbf2Q5SS00 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Zdbf2Q5SS00 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Zdbf2Q5SS00 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Zdbf2Q5SS00 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Zdbf2Q5SS00 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Zdbf2Q5SS00 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Zdbf2Q5SS00 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Zdbf2Q5SS00 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Zdbf2Q5SS00 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Zdbf2Q5SS00 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Zdbf2Q5SS00 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Zdbf2Q5SS00 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Zdbf2Q5SS00 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Zdbf2Q5SS00 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Zdbf2Q5SS00 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Zdbf2Q5SS00 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Zdbf2Q5SS00 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Zdbf2Q5SS00 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Zdbf2Q5SS00 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Zdbf2Q5SS00 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Zdbf2Q5SS00 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Zdbf2Q5SS00 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Zdbf2Q5SS00 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Zdbf2Q5SS00 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Zdbf2Q5SS00 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Zdbf2Q5SS00 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Zdbf2Q5SS00 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Zdbf2Q5SS00 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Zdbf2Q5SS00 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Zdbf2Q5SS00 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Zdbf2Q5SS00 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Zdbf2Q5SS00 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Zdbf2Q5SS00 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Zdbf2Q5SS00 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Zdbf2Q5SS00 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Zdbf2Q5SS00 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Zdbf2Q5SS00 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Zdbf2Q5SS00 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Zdbf2Q5SS00 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Zdbf2Q5SS00 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Zdbf2Q5SS00 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Zdbf2Q5SS00 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Zdbf2Q5SS00 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Zdbf2Q5SS00 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Zdbf2Q5SS00 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Zdbf2Q5SS00 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Zdbf2Q5SS00 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Zdbf2Q5SS00 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Zdbf2Q5SS00 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Zdbf2Q5SS00 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Zdbf2Q5SS00 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Zdbf2Q5SS00 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Zdbf2Q5SS00 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Zdbf2Q5SS00 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Zdbf2Q5SS00 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Zdbf2Q5SS00 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Zdbf2Q5SS00 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Zdbf2Q5SS00 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Zdbf2Q5SS00 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Zdbf2Q5SS00 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Zdbf2Q5SS00 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Zdbf2Q5SS00 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Zdbf2Q5SS00 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Zdbf2Q5SS00 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Zdbf2Q5SS00 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Zdbf2Q5SS00 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Zdbf2Q5SS00 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Zdbf2Q5SS00 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Zdbf2Q5SS00 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Zdbf2Q5SS00 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Zdbf2Q5SS00 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Zdbf2Q5SS00 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Zdbf2Q5SS00 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Zdbf2Q5SS00 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Zdbf2Q5SS00 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Zdbf2Q5SS00 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms