Protein–RNA interactions for Protein: Q5SQY2

Bod1, Biorientation of chromosomes in cell division protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bod1Q5SQY2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Bod1Q5SQY2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Bod1Q5SQY2 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Bod1Q5SQY2 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Bod1Q5SQY2 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Bod1Q5SQY2 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Bod1Q5SQY2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Bod1Q5SQY2 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Bod1Q5SQY2 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Bod1Q5SQY2 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Bod1Q5SQY2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Bod1Q5SQY2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Bod1Q5SQY2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Bod1Q5SQY2 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Bod1Q5SQY2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Bod1Q5SQY2 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Bod1Q5SQY2 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Bod1Q5SQY2 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Bod1Q5SQY2 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Bod1Q5SQY2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Bod1Q5SQY2 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Bod1Q5SQY2 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Bod1Q5SQY2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Bod1Q5SQY2 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Bod1Q5SQY2 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Bod1Q5SQY2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Bod1Q5SQY2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Bod1Q5SQY2 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Bod1Q5SQY2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Bod1Q5SQY2 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Bod1Q5SQY2 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Bod1Q5SQY2 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Bod1Q5SQY2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Bod1Q5SQY2 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Bod1Q5SQY2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Bod1Q5SQY2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Bod1Q5SQY2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Bod1Q5SQY2 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Bod1Q5SQY2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Bod1Q5SQY2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Bod1Q5SQY2 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Bod1Q5SQY2 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Bod1Q5SQY2 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Bod1Q5SQY2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Bod1Q5SQY2 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Bod1Q5SQY2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Bod1Q5SQY2 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Bod1Q5SQY2 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Bod1Q5SQY2 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Bod1Q5SQY2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Bod1Q5SQY2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Bod1Q5SQY2 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Bod1Q5SQY2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Bod1Q5SQY2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Bod1Q5SQY2 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Bod1Q5SQY2 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Bod1Q5SQY2 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Bod1Q5SQY2 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Bod1Q5SQY2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Bod1Q5SQY2 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Bod1Q5SQY2 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Bod1Q5SQY2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Bod1Q5SQY2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Bod1Q5SQY2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Bod1Q5SQY2 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Bod1Q5SQY2 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Bod1Q5SQY2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Bod1Q5SQY2 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Bod1Q5SQY2 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Bod1Q5SQY2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Bod1Q5SQY2 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Bod1Q5SQY2 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Bod1Q5SQY2 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Bod1Q5SQY2 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Bod1Q5SQY2 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Bod1Q5SQY2 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Bod1Q5SQY2 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Bod1Q5SQY2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Bod1Q5SQY2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Bod1Q5SQY2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Bod1Q5SQY2 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Bod1Q5SQY2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Bod1Q5SQY2 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Bod1Q5SQY2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Bod1Q5SQY2 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Bod1Q5SQY2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Bod1Q5SQY2 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Bod1Q5SQY2 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Bod1Q5SQY2 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Bod1Q5SQY2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Bod1Q5SQY2 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Bod1Q5SQY2 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Bod1Q5SQY2 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Bod1Q5SQY2 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Bod1Q5SQY2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Bod1Q5SQY2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Bod1Q5SQY2 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Bod1Q5SQY2 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Bod1Q5SQY2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Bod1Q5SQY2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms