Protein–RNA interactions for Protein: Q5S248

Tmprss11e, Transmembrane protease serine 11E, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmprss11eQ5S248 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Tmprss11eQ5S248 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Tmprss11eQ5S248 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Tmprss11eQ5S248 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Tmprss11eQ5S248 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Tmprss11eQ5S248 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Tmprss11eQ5S248 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Tmprss11eQ5S248 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Tmprss11eQ5S248 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Tmprss11eQ5S248 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Tmprss11eQ5S248 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Tmprss11eQ5S248 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Tmprss11eQ5S248 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Tmprss11eQ5S248 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Tmprss11eQ5S248 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Tmprss11eQ5S248 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Tmprss11eQ5S248 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Tmprss11eQ5S248 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Tmprss11eQ5S248 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Tmprss11eQ5S248 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Tmprss11eQ5S248 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Tmprss11eQ5S248 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Tmprss11eQ5S248 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Tmprss11eQ5S248 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Tmprss11eQ5S248 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Tmprss11eQ5S248 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Tmprss11eQ5S248 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Tmprss11eQ5S248 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Tmprss11eQ5S248 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Tmprss11eQ5S248 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Tmprss11eQ5S248 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Tmprss11eQ5S248 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Tmprss11eQ5S248 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Tmprss11eQ5S248 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Tmprss11eQ5S248 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Tmprss11eQ5S248 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Tmprss11eQ5S248 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Tmprss11eQ5S248 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Tmprss11eQ5S248 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Tmprss11eQ5S248 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Tmprss11eQ5S248 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Tmprss11eQ5S248 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Tmprss11eQ5S248 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Tmprss11eQ5S248 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Tmprss11eQ5S248 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Tmprss11eQ5S248 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Tmprss11eQ5S248 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Tmprss11eQ5S248 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Tmprss11eQ5S248 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Tmprss11eQ5S248 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Tmprss11eQ5S248 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Tmprss11eQ5S248 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Tmprss11eQ5S248 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Tmprss11eQ5S248 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Tmprss11eQ5S248 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Tmprss11eQ5S248 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Tmprss11eQ5S248 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Tmprss11eQ5S248 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Tmprss11eQ5S248 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Tmprss11eQ5S248 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Tmprss11eQ5S248 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Tmprss11eQ5S248 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Tmprss11eQ5S248 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Tmprss11eQ5S248 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Tmprss11eQ5S248 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Tmprss11eQ5S248 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Tmprss11eQ5S248 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Tmprss11eQ5S248 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Tmprss11eQ5S248 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Tmprss11eQ5S248 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Tmprss11eQ5S248 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Tmprss11eQ5S248 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Tmprss11eQ5S248 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Tmprss11eQ5S248 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Tmprss11eQ5S248 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Tmprss11eQ5S248 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Tmprss11eQ5S248 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Tmprss11eQ5S248 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Tmprss11eQ5S248 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
Tmprss11eQ5S248 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Tmprss11eQ5S248 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Tmprss11eQ5S248 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Tmprss11eQ5S248 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Tmprss11eQ5S248 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Tmprss11eQ5S248 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Tmprss11eQ5S248 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Tmprss11eQ5S248 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Tmprss11eQ5S248 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Tmprss11eQ5S248 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Tmprss11eQ5S248 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Tmprss11eQ5S248 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Tmprss11eQ5S248 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Tmprss11eQ5S248 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Tmprss11eQ5S248 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Tmprss11eQ5S248 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Tmprss11eQ5S248 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Tmprss11eQ5S248 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Tmprss11eQ5S248 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Tmprss11eQ5S248 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Tmprss11eQ5S248 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms