Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1A4

Trdv2-2, T cell receptor delta variable 2-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdv2-2Q5R1A4 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trdv2-2Q5R1A4 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trdv2-2Q5R1A4 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trdv2-2Q5R1A4 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trdv2-2Q5R1A4 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trdv2-2Q5R1A4 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trdv2-2Q5R1A4 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trdv2-2Q5R1A4 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trdv2-2Q5R1A4 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trdv2-2Q5R1A4 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trdv2-2Q5R1A4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trdv2-2Q5R1A4 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trdv2-2Q5R1A4 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trdv2-2Q5R1A4 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trdv2-2Q5R1A4 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trdv2-2Q5R1A4 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trdv2-2Q5R1A4 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trdv2-2Q5R1A4 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trdv2-2Q5R1A4 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trdv2-2Q5R1A4 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trdv2-2Q5R1A4 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trdv2-2Q5R1A4 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trdv2-2Q5R1A4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trdv2-2Q5R1A4 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trdv2-2Q5R1A4 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trdv2-2Q5R1A4 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trdv2-2Q5R1A4 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trdv2-2Q5R1A4 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trdv2-2Q5R1A4 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trdv2-2Q5R1A4 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trdv2-2Q5R1A4 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trdv2-2Q5R1A4 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trdv2-2Q5R1A4 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trdv2-2Q5R1A4 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Trdv2-2Q5R1A4 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trdv2-2Q5R1A4 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trdv2-2Q5R1A4 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trdv2-2Q5R1A4 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trdv2-2Q5R1A4 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trdv2-2Q5R1A4 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trdv2-2Q5R1A4 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trdv2-2Q5R1A4 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trdv2-2Q5R1A4 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trdv2-2Q5R1A4 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trdv2-2Q5R1A4 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trdv2-2Q5R1A4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trdv2-2Q5R1A4 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trdv2-2Q5R1A4 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trdv2-2Q5R1A4 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trdv2-2Q5R1A4 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trdv2-2Q5R1A4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trdv2-2Q5R1A4 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trdv2-2Q5R1A4 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trdv2-2Q5R1A4 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trdv2-2Q5R1A4 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trdv2-2Q5R1A4 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trdv2-2Q5R1A4 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trdv2-2Q5R1A4 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trdv2-2Q5R1A4 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trdv2-2Q5R1A4 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trdv2-2Q5R1A4 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trdv2-2Q5R1A4 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trdv2-2Q5R1A4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trdv2-2Q5R1A4 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trdv2-2Q5R1A4 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trdv2-2Q5R1A4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trdv2-2Q5R1A4 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trdv2-2Q5R1A4 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trdv2-2Q5R1A4 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trdv2-2Q5R1A4 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trdv2-2Q5R1A4 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trdv2-2Q5R1A4 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trdv2-2Q5R1A4 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63 ms