Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU56

Nlrc3, Protein NLRC3, mousemouse

Predictions only

Length 1,064 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc3Q5DU56 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nlrc3Q5DU56 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nlrc3Q5DU56 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nlrc3Q5DU56 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nlrc3Q5DU56 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nlrc3Q5DU56 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nlrc3Q5DU56 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nlrc3Q5DU56 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nlrc3Q5DU56 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nlrc3Q5DU56 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nlrc3Q5DU56 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nlrc3Q5DU56 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nlrc3Q5DU56 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nlrc3Q5DU56 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nlrc3Q5DU56 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nlrc3Q5DU56 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Nlrc3Q5DU56 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Nlrc3Q5DU56 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nlrc3Q5DU56 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Nlrc3Q5DU56 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nlrc3Q5DU56 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nlrc3Q5DU56 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nlrc3Q5DU56 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nlrc3Q5DU56 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nlrc3Q5DU56 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nlrc3Q5DU56 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nlrc3Q5DU56 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nlrc3Q5DU56 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nlrc3Q5DU56 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nlrc3Q5DU56 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nlrc3Q5DU56 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nlrc3Q5DU56 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nlrc3Q5DU56 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nlrc3Q5DU56 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nlrc3Q5DU56 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nlrc3Q5DU56 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nlrc3Q5DU56 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nlrc3Q5DU56 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nlrc3Q5DU56 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nlrc3Q5DU56 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nlrc3Q5DU56 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Nlrc3Q5DU56 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nlrc3Q5DU56 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Nlrc3Q5DU56 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nlrc3Q5DU56 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nlrc3Q5DU56 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nlrc3Q5DU56 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nlrc3Q5DU56 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nlrc3Q5DU56 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nlrc3Q5DU56 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Nlrc3Q5DU56 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nlrc3Q5DU56 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nlrc3Q5DU56 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nlrc3Q5DU56 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nlrc3Q5DU56 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nlrc3Q5DU56 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nlrc3Q5DU56 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nlrc3Q5DU56 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nlrc3Q5DU56 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nlrc3Q5DU56 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nlrc3Q5DU56 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nlrc3Q5DU56 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nlrc3Q5DU56 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nlrc3Q5DU56 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nlrc3Q5DU56 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nlrc3Q5DU56 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nlrc3Q5DU56 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nlrc3Q5DU56 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nlrc3Q5DU56 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nlrc3Q5DU56 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nlrc3Q5DU56 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nlrc3Q5DU56 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nlrc3Q5DU56 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nlrc3Q5DU56 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nlrc3Q5DU56 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nlrc3Q5DU56 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nlrc3Q5DU56 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nlrc3Q5DU56 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nlrc3Q5DU56 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nlrc3Q5DU56 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nlrc3Q5DU56 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nlrc3Q5DU56 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nlrc3Q5DU56 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nlrc3Q5DU56 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nlrc3Q5DU56 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nlrc3Q5DU56 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nlrc3Q5DU56 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nlrc3Q5DU56 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nlrc3Q5DU56 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nlrc3Q5DU56 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nlrc3Q5DU56 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nlrc3Q5DU56 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nlrc3Q5DU56 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nlrc3Q5DU56 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nlrc3Q5DU56 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nlrc3Q5DU56 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nlrc3Q5DU56 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nlrc3Q5DU56 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Nlrc3Q5DU56 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nlrc3Q5DU56 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
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