Protein–RNA interactions for Protein: Q499E0

Brinp3, BMP/retinoic acid-inducible neural-specific protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brinp3Q499E0 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Brinp3Q499E0 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Brinp3Q499E0 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
Brinp3Q499E0 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
Brinp3Q499E0 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Brinp3Q499E0 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Brinp3Q499E0 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Brinp3Q499E0 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Brinp3Q499E0 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Brinp3Q499E0 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
Brinp3Q499E0 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Brinp3Q499E0 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Brinp3Q499E0 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC33.62■■■□□ 2.97
Brinp3Q499E0 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Brinp3Q499E0 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Brinp3Q499E0 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Brinp3Q499E0 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
Brinp3Q499E0 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Brinp3Q499E0 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Brinp3Q499E0 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
Brinp3Q499E0 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Brinp3Q499E0 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Brinp3Q499E0 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
Brinp3Q499E0 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
Brinp3Q499E0 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
Brinp3Q499E0 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Brinp3Q499E0 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC33.54■■■□□ 2.96
Brinp3Q499E0 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Brinp3Q499E0 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Brinp3Q499E0 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Brinp3Q499E0 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Brinp3Q499E0 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Brinp3Q499E0 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Brinp3Q499E0 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Brinp3Q499E0 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
Brinp3Q499E0 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
Brinp3Q499E0 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
Brinp3Q499E0 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Brinp3Q499E0 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Brinp3Q499E0 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC33.47■■■□□ 2.95
Brinp3Q499E0 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Brinp3Q499E0 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
Brinp3Q499E0 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC33.45■■■□□ 2.95
Brinp3Q499E0 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Brinp3Q499E0 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Brinp3Q499E0 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Brinp3Q499E0 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Brinp3Q499E0 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Brinp3Q499E0 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Brinp3Q499E0 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Brinp3Q499E0 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Brinp3Q499E0 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Brinp3Q499E0 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Brinp3Q499E0 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
Brinp3Q499E0 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
Brinp3Q499E0 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Brinp3Q499E0 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Brinp3Q499E0 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
Brinp3Q499E0 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
Brinp3Q499E0 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC33.35■■■□□ 2.93
Brinp3Q499E0 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Brinp3Q499E0 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Brinp3Q499E0 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Brinp3Q499E0 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
Brinp3Q499E0 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Brinp3Q499E0 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Brinp3Q499E0 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
Brinp3Q499E0 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Brinp3Q499E0 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Brinp3Q499E0 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Brinp3Q499E0 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
Brinp3Q499E0 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Brinp3Q499E0 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Brinp3Q499E0 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Brinp3Q499E0 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
Brinp3Q499E0 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Brinp3Q499E0 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
Brinp3Q499E0 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Brinp3Q499E0 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Brinp3Q499E0 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Brinp3Q499E0 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC33.23■■■□□ 2.91
Brinp3Q499E0 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
Brinp3Q499E0 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Brinp3Q499E0 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Brinp3Q499E0 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Brinp3Q499E0 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Brinp3Q499E0 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
Brinp3Q499E0 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
Brinp3Q499E0 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Brinp3Q499E0 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Brinp3Q499E0 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Brinp3Q499E0 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
Brinp3Q499E0 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Brinp3Q499E0 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
Brinp3Q499E0 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Brinp3Q499E0 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Brinp3Q499E0 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Brinp3Q499E0 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Brinp3Q499E0 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
Brinp3Q499E0 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.2 ms