Protein–RNA interactions for Protein: Q497S0

Gm5935, EG546282 protein, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5935Q497S0 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gm5935Q497S0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gm5935Q497S0 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gm5935Q497S0 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gm5935Q497S0 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gm5935Q497S0 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gm5935Q497S0 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gm5935Q497S0 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gm5935Q497S0 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gm5935Q497S0 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gm5935Q497S0 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gm5935Q497S0 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gm5935Q497S0 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gm5935Q497S0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gm5935Q497S0 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gm5935Q497S0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gm5935Q497S0 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gm5935Q497S0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gm5935Q497S0 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gm5935Q497S0 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gm5935Q497S0 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gm5935Q497S0 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gm5935Q497S0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gm5935Q497S0 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gm5935Q497S0 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Gm5935Q497S0 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gm5935Q497S0 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gm5935Q497S0 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gm5935Q497S0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gm5935Q497S0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Gm5935Q497S0 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gm5935Q497S0 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gm5935Q497S0 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gm5935Q497S0 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Gm5935Q497S0 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gm5935Q497S0 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gm5935Q497S0 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gm5935Q497S0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gm5935Q497S0 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gm5935Q497S0 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gm5935Q497S0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gm5935Q497S0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gm5935Q497S0 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gm5935Q497S0 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gm5935Q497S0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gm5935Q497S0 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Gm5935Q497S0 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gm5935Q497S0 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gm5935Q497S0 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Gm5935Q497S0 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gm5935Q497S0 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gm5935Q497S0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gm5935Q497S0 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gm5935Q497S0 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gm5935Q497S0 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gm5935Q497S0 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gm5935Q497S0 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gm5935Q497S0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gm5935Q497S0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gm5935Q497S0 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gm5935Q497S0 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gm5935Q497S0 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gm5935Q497S0 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gm5935Q497S0 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gm5935Q497S0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gm5935Q497S0 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gm5935Q497S0 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gm5935Q497S0 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gm5935Q497S0 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Gm5935Q497S0 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gm5935Q497S0 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gm5935Q497S0 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gm5935Q497S0 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gm5935Q497S0 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gm5935Q497S0 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Gm5935Q497S0 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gm5935Q497S0 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gm5935Q497S0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gm5935Q497S0 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Gm5935Q497S0 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gm5935Q497S0 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Gm5935Q497S0 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gm5935Q497S0 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gm5935Q497S0 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Gm5935Q497S0 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Gm5935Q497S0 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Gm5935Q497S0 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gm5935Q497S0 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gm5935Q497S0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gm5935Q497S0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gm5935Q497S0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gm5935Q497S0 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Gm5935Q497S0 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gm5935Q497S0 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gm5935Q497S0 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gm5935Q497S0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gm5935Q497S0 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gm5935Q497S0 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Gm5935Q497S0 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gm5935Q497S0 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms