Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0I2

Prr7, Proline-rich protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr7Q3V0I2 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Prr7Q3V0I2 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Prr7Q3V0I2 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Prr7Q3V0I2 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Prr7Q3V0I2 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Prr7Q3V0I2 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Prr7Q3V0I2 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Prr7Q3V0I2 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Prr7Q3V0I2 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Prr7Q3V0I2 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Prr7Q3V0I2 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Prr7Q3V0I2 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Prr7Q3V0I2 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Prr7Q3V0I2 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Prr7Q3V0I2 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Prr7Q3V0I2 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Prr7Q3V0I2 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Prr7Q3V0I2 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Prr7Q3V0I2 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Prr7Q3V0I2 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Prr7Q3V0I2 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Prr7Q3V0I2 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Prr7Q3V0I2 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Prr7Q3V0I2 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Prr7Q3V0I2 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Prr7Q3V0I2 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Prr7Q3V0I2 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Prr7Q3V0I2 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Prr7Q3V0I2 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Prr7Q3V0I2 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Prr7Q3V0I2 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Prr7Q3V0I2 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Prr7Q3V0I2 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Prr7Q3V0I2 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Prr7Q3V0I2 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Prr7Q3V0I2 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Prr7Q3V0I2 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Prr7Q3V0I2 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Prr7Q3V0I2 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Prr7Q3V0I2 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Prr7Q3V0I2 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Prr7Q3V0I2 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Prr7Q3V0I2 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Prr7Q3V0I2 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Prr7Q3V0I2 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Prr7Q3V0I2 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Prr7Q3V0I2 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Prr7Q3V0I2 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Prr7Q3V0I2 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Prr7Q3V0I2 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Prr7Q3V0I2 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Prr7Q3V0I2 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Prr7Q3V0I2 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Prr7Q3V0I2 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Prr7Q3V0I2 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Prr7Q3V0I2 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Prr7Q3V0I2 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Prr7Q3V0I2 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Prr7Q3V0I2 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Prr7Q3V0I2 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Prr7Q3V0I2 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Prr7Q3V0I2 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Prr7Q3V0I2 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Prr7Q3V0I2 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Prr7Q3V0I2 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Prr7Q3V0I2 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Prr7Q3V0I2 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Prr7Q3V0I2 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Prr7Q3V0I2 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Prr7Q3V0I2 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Prr7Q3V0I2 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Prr7Q3V0I2 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Prr7Q3V0I2 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Prr7Q3V0I2 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Prr7Q3V0I2 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Prr7Q3V0I2 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Prr7Q3V0I2 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Prr7Q3V0I2 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Prr7Q3V0I2 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Prr7Q3V0I2 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Prr7Q3V0I2 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Prr7Q3V0I2 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Prr7Q3V0I2 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Prr7Q3V0I2 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Prr7Q3V0I2 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
Prr7Q3V0I2 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Prr7Q3V0I2 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Prr7Q3V0I2 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
Prr7Q3V0I2 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Prr7Q3V0I2 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Prr7Q3V0I2 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Prr7Q3V0I2 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
Prr7Q3V0I2 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Prr7Q3V0I2 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Prr7Q3V0I2 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Prr7Q3V0I2 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Prr7Q3V0I2 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Prr7Q3V0I2 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Prr7Q3V0I2 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Prr7Q3V0I2 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms