Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZV7

UPF0577 protein KIAA1324-like homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3UZV7 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Q3UZV7 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Q3UZV7 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Q3UZV7 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q3UZV7 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q3UZV7 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q3UZV7 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q3UZV7 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q3UZV7 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q3UZV7 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Q3UZV7 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q3UZV7 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Q3UZV7 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Q3UZV7 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q3UZV7 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q3UZV7 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q3UZV7 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Q3UZV7 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q3UZV7 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q3UZV7 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Q3UZV7 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q3UZV7 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q3UZV7 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q3UZV7 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q3UZV7 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q3UZV7 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q3UZV7 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q3UZV7 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q3UZV7 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q3UZV7 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q3UZV7 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q3UZV7 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q3UZV7 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q3UZV7 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Q3UZV7 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q3UZV7 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q3UZV7 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q3UZV7 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q3UZV7 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q3UZV7 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q3UZV7 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q3UZV7 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q3UZV7 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q3UZV7 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q3UZV7 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q3UZV7 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q3UZV7 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q3UZV7 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q3UZV7 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q3UZV7 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q3UZV7 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q3UZV7 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q3UZV7 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Q3UZV7 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q3UZV7 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q3UZV7 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q3UZV7 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q3UZV7 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q3UZV7 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Q3UZV7 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q3UZV7 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Q3UZV7 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q3UZV7 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q3UZV7 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q3UZV7 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q3UZV7 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q3UZV7 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q3UZV7 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q3UZV7 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q3UZV7 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q3UZV7 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q3UZV7 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Q3UZV7 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Q3UZV7 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q3UZV7 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Q3UZV7 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q3UZV7 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Q3UZV7 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Q3UZV7 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Q3UZV7 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Q3UZV7 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Q3UZV7 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Q3UZV7 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Q3UZV7 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Q3UZV7 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Q3UZV7 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Q3UZV7 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Q3UZV7 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Q3UZV7 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Q3UZV7 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Q3UZV7 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Q3UZV7 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Q3UZV7 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Q3UZV7 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Q3UZV7 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Q3UZV7 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Q3UZV7 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Q3UZV7 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Q3UZV7 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Q3UZV7 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.9 ms