Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZP4

Svip, Small VCP/p97-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvipQ3UZP4 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SvipQ3UZP4 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SvipQ3UZP4 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SvipQ3UZP4 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SvipQ3UZP4 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SvipQ3UZP4 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SvipQ3UZP4 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SvipQ3UZP4 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SvipQ3UZP4 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SvipQ3UZP4 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SvipQ3UZP4 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SvipQ3UZP4 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SvipQ3UZP4 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SvipQ3UZP4 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SvipQ3UZP4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SvipQ3UZP4 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SvipQ3UZP4 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SvipQ3UZP4 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SvipQ3UZP4 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SvipQ3UZP4 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SvipQ3UZP4 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SvipQ3UZP4 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SvipQ3UZP4 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SvipQ3UZP4 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SvipQ3UZP4 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SvipQ3UZP4 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SvipQ3UZP4 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SvipQ3UZP4 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SvipQ3UZP4 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SvipQ3UZP4 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SvipQ3UZP4 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SvipQ3UZP4 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SvipQ3UZP4 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SvipQ3UZP4 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SvipQ3UZP4 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SvipQ3UZP4 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SvipQ3UZP4 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SvipQ3UZP4 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SvipQ3UZP4 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SvipQ3UZP4 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SvipQ3UZP4 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SvipQ3UZP4 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SvipQ3UZP4 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SvipQ3UZP4 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SvipQ3UZP4 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SvipQ3UZP4 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SvipQ3UZP4 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SvipQ3UZP4 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SvipQ3UZP4 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SvipQ3UZP4 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SvipQ3UZP4 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SvipQ3UZP4 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SvipQ3UZP4 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SvipQ3UZP4 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SvipQ3UZP4 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SvipQ3UZP4 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SvipQ3UZP4 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SvipQ3UZP4 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SvipQ3UZP4 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SvipQ3UZP4 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SvipQ3UZP4 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SvipQ3UZP4 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SvipQ3UZP4 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SvipQ3UZP4 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SvipQ3UZP4 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SvipQ3UZP4 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SvipQ3UZP4 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SvipQ3UZP4 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SvipQ3UZP4 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SvipQ3UZP4 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SvipQ3UZP4 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SvipQ3UZP4 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SvipQ3UZP4 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SvipQ3UZP4 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SvipQ3UZP4 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SvipQ3UZP4 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SvipQ3UZP4 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SvipQ3UZP4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SvipQ3UZP4 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SvipQ3UZP4 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SvipQ3UZP4 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SvipQ3UZP4 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SvipQ3UZP4 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SvipQ3UZP4 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SvipQ3UZP4 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SvipQ3UZP4 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SvipQ3UZP4 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SvipQ3UZP4 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SvipQ3UZP4 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SvipQ3UZP4 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SvipQ3UZP4 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SvipQ3UZP4 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SvipQ3UZP4 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SvipQ3UZP4 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SvipQ3UZP4 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SvipQ3UZP4 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SvipQ3UZP4 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SvipQ3UZP4 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SvipQ3UZP4 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SvipQ3UZP4 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms