Protein–RNA interactions for Protein: Q3UX62

Ccdc114, Coiled-coil domain-containing protein 114, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc114Q3UX62 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc114Q3UX62 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc114Q3UX62 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc114Q3UX62 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc114Q3UX62 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc114Q3UX62 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc114Q3UX62 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc114Q3UX62 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc114Q3UX62 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc114Q3UX62 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc114Q3UX62 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc114Q3UX62 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc114Q3UX62 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc114Q3UX62 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc114Q3UX62 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc114Q3UX62 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ccdc114Q3UX62 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc114Q3UX62 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc114Q3UX62 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc114Q3UX62 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc114Q3UX62 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc114Q3UX62 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc114Q3UX62 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc114Q3UX62 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc114Q3UX62 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc114Q3UX62 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc114Q3UX62 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc114Q3UX62 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc114Q3UX62 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc114Q3UX62 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc114Q3UX62 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc114Q3UX62 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc114Q3UX62 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc114Q3UX62 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc114Q3UX62 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc114Q3UX62 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ccdc114Q3UX62 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ccdc114Q3UX62 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc114Q3UX62 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc114Q3UX62 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc114Q3UX62 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc114Q3UX62 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc114Q3UX62 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc114Q3UX62 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc114Q3UX62 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc114Q3UX62 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc114Q3UX62 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc114Q3UX62 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc114Q3UX62 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc114Q3UX62 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc114Q3UX62 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc114Q3UX62 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc114Q3UX62 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc114Q3UX62 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc114Q3UX62 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc114Q3UX62 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc114Q3UX62 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc114Q3UX62 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc114Q3UX62 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc114Q3UX62 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc114Q3UX62 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc114Q3UX62 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc114Q3UX62 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc114Q3UX62 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc114Q3UX62 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc114Q3UX62 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc114Q3UX62 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc114Q3UX62 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc114Q3UX62 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc114Q3UX62 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc114Q3UX62 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc114Q3UX62 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc114Q3UX62 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc114Q3UX62 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc114Q3UX62 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc114Q3UX62 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc114Q3UX62 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc114Q3UX62 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc114Q3UX62 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc114Q3UX62 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc114Q3UX62 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc114Q3UX62 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc114Q3UX62 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc114Q3UX62 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc114Q3UX62 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc114Q3UX62 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc114Q3UX62 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc114Q3UX62 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc114Q3UX62 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc114Q3UX62 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc114Q3UX62 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc114Q3UX62 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc114Q3UX62 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc114Q3UX62 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc114Q3UX62 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ccdc114Q3UX62 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc114Q3UX62 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc114Q3UX62 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc114Q3UX62 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc114Q3UX62 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms