Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWQ3

Ube2fb, NEDD8-conjugating enzyme UBE2F-B, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2fbQ3UWQ3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ube2fbQ3UWQ3 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ube2fbQ3UWQ3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ube2fbQ3UWQ3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ube2fbQ3UWQ3 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ube2fbQ3UWQ3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ube2fbQ3UWQ3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ube2fbQ3UWQ3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ube2fbQ3UWQ3 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ube2fbQ3UWQ3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ube2fbQ3UWQ3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ube2fbQ3UWQ3 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ube2fbQ3UWQ3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ube2fbQ3UWQ3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ube2fbQ3UWQ3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ube2fbQ3UWQ3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ube2fbQ3UWQ3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ube2fbQ3UWQ3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ube2fbQ3UWQ3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ube2fbQ3UWQ3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ube2fbQ3UWQ3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ube2fbQ3UWQ3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ube2fbQ3UWQ3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ube2fbQ3UWQ3 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ube2fbQ3UWQ3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ube2fbQ3UWQ3 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ube2fbQ3UWQ3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ube2fbQ3UWQ3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ube2fbQ3UWQ3 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ube2fbQ3UWQ3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ube2fbQ3UWQ3 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ube2fbQ3UWQ3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ube2fbQ3UWQ3 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ube2fbQ3UWQ3 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ube2fbQ3UWQ3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ube2fbQ3UWQ3 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ube2fbQ3UWQ3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ube2fbQ3UWQ3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ube2fbQ3UWQ3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ube2fbQ3UWQ3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ube2fbQ3UWQ3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ube2fbQ3UWQ3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ube2fbQ3UWQ3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ube2fbQ3UWQ3 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ube2fbQ3UWQ3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ube2fbQ3UWQ3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ube2fbQ3UWQ3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ube2fbQ3UWQ3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ube2fbQ3UWQ3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ube2fbQ3UWQ3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ube2fbQ3UWQ3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ube2fbQ3UWQ3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ube2fbQ3UWQ3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ube2fbQ3UWQ3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ube2fbQ3UWQ3 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ube2fbQ3UWQ3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ube2fbQ3UWQ3 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ube2fbQ3UWQ3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ube2fbQ3UWQ3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ube2fbQ3UWQ3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ube2fbQ3UWQ3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ube2fbQ3UWQ3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ube2fbQ3UWQ3 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ube2fbQ3UWQ3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ube2fbQ3UWQ3 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Ube2fbQ3UWQ3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ube2fbQ3UWQ3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ube2fbQ3UWQ3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ube2fbQ3UWQ3 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Ube2fbQ3UWQ3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ube2fbQ3UWQ3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ube2fbQ3UWQ3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ube2fbQ3UWQ3 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ube2fbQ3UWQ3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ube2fbQ3UWQ3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ube2fbQ3UWQ3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ube2fbQ3UWQ3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ube2fbQ3UWQ3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ube2fbQ3UWQ3 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Ube2fbQ3UWQ3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ube2fbQ3UWQ3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ube2fbQ3UWQ3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ube2fbQ3UWQ3 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ube2fbQ3UWQ3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ube2fbQ3UWQ3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ube2fbQ3UWQ3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ube2fbQ3UWQ3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ube2fbQ3UWQ3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ube2fbQ3UWQ3 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ube2fbQ3UWQ3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ube2fbQ3UWQ3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ube2fbQ3UWQ3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ube2fbQ3UWQ3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ube2fbQ3UWQ3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ube2fbQ3UWQ3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ube2fbQ3UWQ3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ube2fbQ3UWQ3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ube2fbQ3UWQ3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ube2fbQ3UWQ3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ube2fbQ3UWQ3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms