Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPL6

Ms4a15, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 15, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a15Q3UPL6 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ms4a15Q3UPL6 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ms4a15Q3UPL6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ms4a15Q3UPL6 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ms4a15Q3UPL6 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ms4a15Q3UPL6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ms4a15Q3UPL6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ms4a15Q3UPL6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Ms4a15Q3UPL6 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ms4a15Q3UPL6 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ms4a15Q3UPL6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ms4a15Q3UPL6 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ms4a15Q3UPL6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ms4a15Q3UPL6 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ms4a15Q3UPL6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ms4a15Q3UPL6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ms4a15Q3UPL6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ms4a15Q3UPL6 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ms4a15Q3UPL6 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ms4a15Q3UPL6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ms4a15Q3UPL6 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ms4a15Q3UPL6 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ms4a15Q3UPL6 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ms4a15Q3UPL6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ms4a15Q3UPL6 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ms4a15Q3UPL6 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ms4a15Q3UPL6 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ms4a15Q3UPL6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ms4a15Q3UPL6 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ms4a15Q3UPL6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ms4a15Q3UPL6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ms4a15Q3UPL6 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ms4a15Q3UPL6 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ms4a15Q3UPL6 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ms4a15Q3UPL6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ms4a15Q3UPL6 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ms4a15Q3UPL6 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ms4a15Q3UPL6 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ms4a15Q3UPL6 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ms4a15Q3UPL6 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ms4a15Q3UPL6 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ms4a15Q3UPL6 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ms4a15Q3UPL6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ms4a15Q3UPL6 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ms4a15Q3UPL6 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ms4a15Q3UPL6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ms4a15Q3UPL6 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ms4a15Q3UPL6 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Ms4a15Q3UPL6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ms4a15Q3UPL6 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ms4a15Q3UPL6 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ms4a15Q3UPL6 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ms4a15Q3UPL6 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ms4a15Q3UPL6 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ms4a15Q3UPL6 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ms4a15Q3UPL6 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ms4a15Q3UPL6 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ms4a15Q3UPL6 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ms4a15Q3UPL6 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ms4a15Q3UPL6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ms4a15Q3UPL6 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ms4a15Q3UPL6 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ms4a15Q3UPL6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ms4a15Q3UPL6 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ms4a15Q3UPL6 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ms4a15Q3UPL6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ms4a15Q3UPL6 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Ms4a15Q3UPL6 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ms4a15Q3UPL6 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ms4a15Q3UPL6 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ms4a15Q3UPL6 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ms4a15Q3UPL6 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ms4a15Q3UPL6 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ms4a15Q3UPL6 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ms4a15Q3UPL6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ms4a15Q3UPL6 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ms4a15Q3UPL6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ms4a15Q3UPL6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ms4a15Q3UPL6 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ms4a15Q3UPL6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ms4a15Q3UPL6 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ms4a15Q3UPL6 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ms4a15Q3UPL6 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ms4a15Q3UPL6 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ms4a15Q3UPL6 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ms4a15Q3UPL6 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ms4a15Q3UPL6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ms4a15Q3UPL6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ms4a15Q3UPL6 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ms4a15Q3UPL6 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ms4a15Q3UPL6 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ms4a15Q3UPL6 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ms4a15Q3UPL6 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ms4a15Q3UPL6 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ms4a15Q3UPL6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ms4a15Q3UPL6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ms4a15Q3UPL6 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ms4a15Q3UPL6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ms4a15Q3UPL6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ms4a15Q3UPL6 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms