Protein–RNA interactions for Protein: Q3UN04

Usp30, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp30Q3UN04 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Usp30Q3UN04 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Usp30Q3UN04 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Usp30Q3UN04 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Usp30Q3UN04 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Usp30Q3UN04 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Usp30Q3UN04 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Usp30Q3UN04 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Usp30Q3UN04 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp30Q3UN04 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp30Q3UN04 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp30Q3UN04 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Usp30Q3UN04 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Usp30Q3UN04 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Usp30Q3UN04 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Usp30Q3UN04 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp30Q3UN04 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp30Q3UN04 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp30Q3UN04 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp30Q3UN04 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp30Q3UN04 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp30Q3UN04 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp30Q3UN04 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp30Q3UN04 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp30Q3UN04 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp30Q3UN04 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Usp30Q3UN04 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Usp30Q3UN04 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Usp30Q3UN04 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Usp30Q3UN04 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp30Q3UN04 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp30Q3UN04 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Usp30Q3UN04 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Usp30Q3UN04 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Usp30Q3UN04 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Usp30Q3UN04 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Usp30Q3UN04 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Usp30Q3UN04 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Usp30Q3UN04 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp30Q3UN04 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp30Q3UN04 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp30Q3UN04 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Usp30Q3UN04 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Usp30Q3UN04 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Usp30Q3UN04 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Usp30Q3UN04 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Usp30Q3UN04 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Usp30Q3UN04 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Usp30Q3UN04 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Usp30Q3UN04 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Usp30Q3UN04 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Usp30Q3UN04 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Usp30Q3UN04 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Usp30Q3UN04 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Usp30Q3UN04 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Usp30Q3UN04 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Usp30Q3UN04 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp30Q3UN04 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp30Q3UN04 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp30Q3UN04 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp30Q3UN04 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp30Q3UN04 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp30Q3UN04 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Usp30Q3UN04 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Usp30Q3UN04 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
Usp30Q3UN04 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Usp30Q3UN04 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Usp30Q3UN04 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Usp30Q3UN04 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Usp30Q3UN04 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Usp30Q3UN04 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Usp30Q3UN04 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Usp30Q3UN04 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Usp30Q3UN04 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Usp30Q3UN04 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Usp30Q3UN04 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp30Q3UN04 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp30Q3UN04 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp30Q3UN04 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp30Q3UN04 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp30Q3UN04 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp30Q3UN04 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp30Q3UN04 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp30Q3UN04 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Usp30Q3UN04 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Usp30Q3UN04 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Usp30Q3UN04 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Usp30Q3UN04 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Usp30Q3UN04 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Usp30Q3UN04 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Usp30Q3UN04 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Usp30Q3UN04 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Usp30Q3UN04 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Usp30Q3UN04 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Usp30Q3UN04 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Usp30Q3UN04 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Usp30Q3UN04 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp30Q3UN04 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp30Q3UN04 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp30Q3UN04 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 376.4 ms