Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULK5

Gal3st2c, Galactose-3-O-sulfotransferase 2C, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gal3st2cQ3ULK5 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gal3st2cQ3ULK5 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gal3st2cQ3ULK5 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gal3st2cQ3ULK5 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gal3st2cQ3ULK5 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gal3st2cQ3ULK5 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gal3st2cQ3ULK5 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gal3st2cQ3ULK5 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gal3st2cQ3ULK5 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gal3st2cQ3ULK5 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gal3st2cQ3ULK5 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gal3st2cQ3ULK5 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gal3st2cQ3ULK5 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gal3st2cQ3ULK5 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gal3st2cQ3ULK5 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gal3st2cQ3ULK5 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gal3st2cQ3ULK5 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gal3st2cQ3ULK5 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gal3st2cQ3ULK5 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gal3st2cQ3ULK5 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Gal3st2cQ3ULK5 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gal3st2cQ3ULK5 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gal3st2cQ3ULK5 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gal3st2cQ3ULK5 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gal3st2cQ3ULK5 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gal3st2cQ3ULK5 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gal3st2cQ3ULK5 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gal3st2cQ3ULK5 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gal3st2cQ3ULK5 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gal3st2cQ3ULK5 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gal3st2cQ3ULK5 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gal3st2cQ3ULK5 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gal3st2cQ3ULK5 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gal3st2cQ3ULK5 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gal3st2cQ3ULK5 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Gal3st2cQ3ULK5 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gal3st2cQ3ULK5 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gal3st2cQ3ULK5 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gal3st2cQ3ULK5 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gal3st2cQ3ULK5 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gal3st2cQ3ULK5 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gal3st2cQ3ULK5 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gal3st2cQ3ULK5 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gal3st2cQ3ULK5 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gal3st2cQ3ULK5 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gal3st2cQ3ULK5 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gal3st2cQ3ULK5 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gal3st2cQ3ULK5 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Gal3st2cQ3ULK5 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gal3st2cQ3ULK5 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Gal3st2cQ3ULK5 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gal3st2cQ3ULK5 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gal3st2cQ3ULK5 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gal3st2cQ3ULK5 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gal3st2cQ3ULK5 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gal3st2cQ3ULK5 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gal3st2cQ3ULK5 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gal3st2cQ3ULK5 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gal3st2cQ3ULK5 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gal3st2cQ3ULK5 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gal3st2cQ3ULK5 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gal3st2cQ3ULK5 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gal3st2cQ3ULK5 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gal3st2cQ3ULK5 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gal3st2cQ3ULK5 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gal3st2cQ3ULK5 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gal3st2cQ3ULK5 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gal3st2cQ3ULK5 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gal3st2cQ3ULK5 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gal3st2cQ3ULK5 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gal3st2cQ3ULK5 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gal3st2cQ3ULK5 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gal3st2cQ3ULK5 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gal3st2cQ3ULK5 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gal3st2cQ3ULK5 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gal3st2cQ3ULK5 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gal3st2cQ3ULK5 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gal3st2cQ3ULK5 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gal3st2cQ3ULK5 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gal3st2cQ3ULK5 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gal3st2cQ3ULK5 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gal3st2cQ3ULK5 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gal3st2cQ3ULK5 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gal3st2cQ3ULK5 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gal3st2cQ3ULK5 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gal3st2cQ3ULK5 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gal3st2cQ3ULK5 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gal3st2cQ3ULK5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gal3st2cQ3ULK5 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gal3st2cQ3ULK5 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gal3st2cQ3ULK5 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gal3st2cQ3ULK5 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gal3st2cQ3ULK5 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gal3st2cQ3ULK5 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gal3st2cQ3ULK5 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gal3st2cQ3ULK5 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gal3st2cQ3ULK5 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gal3st2cQ3ULK5 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Gal3st2cQ3ULK5 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gal3st2cQ3ULK5 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms