Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULK5

Gal3st2c, Galactose-3-O-sulfotransferase 2C, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gal3st2cQ3ULK5 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gal3st2cQ3ULK5 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gal3st2cQ3ULK5 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gal3st2cQ3ULK5 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gal3st2cQ3ULK5 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gal3st2cQ3ULK5 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gal3st2cQ3ULK5 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gal3st2cQ3ULK5 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gal3st2cQ3ULK5 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gal3st2cQ3ULK5 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gal3st2cQ3ULK5 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gal3st2cQ3ULK5 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gal3st2cQ3ULK5 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gal3st2cQ3ULK5 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gal3st2cQ3ULK5 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gal3st2cQ3ULK5 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gal3st2cQ3ULK5 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gal3st2cQ3ULK5 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gal3st2cQ3ULK5 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gal3st2cQ3ULK5 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Gal3st2cQ3ULK5 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gal3st2cQ3ULK5 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gal3st2cQ3ULK5 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gal3st2cQ3ULK5 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gal3st2cQ3ULK5 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gal3st2cQ3ULK5 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gal3st2cQ3ULK5 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gal3st2cQ3ULK5 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gal3st2cQ3ULK5 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gal3st2cQ3ULK5 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gal3st2cQ3ULK5 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gal3st2cQ3ULK5 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gal3st2cQ3ULK5 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gal3st2cQ3ULK5 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gal3st2cQ3ULK5 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Gal3st2cQ3ULK5 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gal3st2cQ3ULK5 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gal3st2cQ3ULK5 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gal3st2cQ3ULK5 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gal3st2cQ3ULK5 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gal3st2cQ3ULK5 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gal3st2cQ3ULK5 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gal3st2cQ3ULK5 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gal3st2cQ3ULK5 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gal3st2cQ3ULK5 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gal3st2cQ3ULK5 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gal3st2cQ3ULK5 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gal3st2cQ3ULK5 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Gal3st2cQ3ULK5 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gal3st2cQ3ULK5 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Gal3st2cQ3ULK5 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gal3st2cQ3ULK5 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gal3st2cQ3ULK5 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gal3st2cQ3ULK5 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gal3st2cQ3ULK5 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gal3st2cQ3ULK5 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gal3st2cQ3ULK5 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gal3st2cQ3ULK5 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gal3st2cQ3ULK5 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gal3st2cQ3ULK5 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gal3st2cQ3ULK5 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gal3st2cQ3ULK5 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gal3st2cQ3ULK5 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gal3st2cQ3ULK5 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gal3st2cQ3ULK5 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gal3st2cQ3ULK5 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gal3st2cQ3ULK5 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gal3st2cQ3ULK5 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gal3st2cQ3ULK5 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gal3st2cQ3ULK5 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gal3st2cQ3ULK5 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gal3st2cQ3ULK5 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gal3st2cQ3ULK5 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gal3st2cQ3ULK5 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gal3st2cQ3ULK5 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gal3st2cQ3ULK5 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gal3st2cQ3ULK5 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gal3st2cQ3ULK5 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gal3st2cQ3ULK5 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gal3st2cQ3ULK5 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gal3st2cQ3ULK5 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gal3st2cQ3ULK5 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gal3st2cQ3ULK5 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gal3st2cQ3ULK5 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gal3st2cQ3ULK5 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gal3st2cQ3ULK5 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gal3st2cQ3ULK5 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gal3st2cQ3ULK5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gal3st2cQ3ULK5 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gal3st2cQ3ULK5 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gal3st2cQ3ULK5 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gal3st2cQ3ULK5 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gal3st2cQ3ULK5 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gal3st2cQ3ULK5 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gal3st2cQ3ULK5 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gal3st2cQ3ULK5 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gal3st2cQ3ULK5 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gal3st2cQ3ULK5 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Gal3st2cQ3ULK5 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gal3st2cQ3ULK5 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms