Protein–RNA interactions for Protein: Q3U435

Mmp25, Matrix metalloproteinase-25, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp25Q3U435 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mmp25Q3U435 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mmp25Q3U435 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mmp25Q3U435 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mmp25Q3U435 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mmp25Q3U435 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Mmp25Q3U435 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mmp25Q3U435 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Mmp25Q3U435 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mmp25Q3U435 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mmp25Q3U435 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Mmp25Q3U435 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mmp25Q3U435 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mmp25Q3U435 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mmp25Q3U435 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mmp25Q3U435 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mmp25Q3U435 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mmp25Q3U435 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mmp25Q3U435 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mmp25Q3U435 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mmp25Q3U435 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mmp25Q3U435 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mmp25Q3U435 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mmp25Q3U435 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mmp25Q3U435 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mmp25Q3U435 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mmp25Q3U435 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mmp25Q3U435 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mmp25Q3U435 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mmp25Q3U435 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mmp25Q3U435 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Mmp25Q3U435 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Mmp25Q3U435 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Mmp25Q3U435 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mmp25Q3U435 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mmp25Q3U435 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mmp25Q3U435 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mmp25Q3U435 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mmp25Q3U435 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mmp25Q3U435 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mmp25Q3U435 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mmp25Q3U435 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mmp25Q3U435 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mmp25Q3U435 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mmp25Q3U435 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mmp25Q3U435 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mmp25Q3U435 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mmp25Q3U435 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mmp25Q3U435 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mmp25Q3U435 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mmp25Q3U435 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mmp25Q3U435 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mmp25Q3U435 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mmp25Q3U435 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mmp25Q3U435 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mmp25Q3U435 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mmp25Q3U435 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mmp25Q3U435 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mmp25Q3U435 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mmp25Q3U435 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mmp25Q3U435 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mmp25Q3U435 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mmp25Q3U435 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mmp25Q3U435 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mmp25Q3U435 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mmp25Q3U435 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mmp25Q3U435 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mmp25Q3U435 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mmp25Q3U435 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mmp25Q3U435 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mmp25Q3U435 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mmp25Q3U435 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mmp25Q3U435 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mmp25Q3U435 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mmp25Q3U435 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mmp25Q3U435 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mmp25Q3U435 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Mmp25Q3U435 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mmp25Q3U435 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mmp25Q3U435 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mmp25Q3U435 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mmp25Q3U435 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mmp25Q3U435 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mmp25Q3U435 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mmp25Q3U435 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mmp25Q3U435 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mmp25Q3U435 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Mmp25Q3U435 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mmp25Q3U435 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mmp25Q3U435 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mmp25Q3U435 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mmp25Q3U435 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Mmp25Q3U435 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mmp25Q3U435 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mmp25Q3U435 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mmp25Q3U435 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Mmp25Q3U435 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mmp25Q3U435 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mmp25Q3U435 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mmp25Q3U435 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms