Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K5

Kdm4d, Lysine-specific demethylase 4D, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4dQ3U2K5 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Kdm4dQ3U2K5 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Kdm4dQ3U2K5 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Kdm4dQ3U2K5 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Kdm4dQ3U2K5 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Kdm4dQ3U2K5 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Kdm4dQ3U2K5 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Kdm4dQ3U2K5 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Kdm4dQ3U2K5 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Kdm4dQ3U2K5 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Kdm4dQ3U2K5 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Kdm4dQ3U2K5 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Kdm4dQ3U2K5 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Kdm4dQ3U2K5 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kdm4dQ3U2K5 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Kdm4dQ3U2K5 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kdm4dQ3U2K5 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Kdm4dQ3U2K5 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Kdm4dQ3U2K5 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Kdm4dQ3U2K5 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Kdm4dQ3U2K5 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Kdm4dQ3U2K5 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Kdm4dQ3U2K5 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Kdm4dQ3U2K5 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Kdm4dQ3U2K5 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Kdm4dQ3U2K5 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Kdm4dQ3U2K5 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Kdm4dQ3U2K5 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Kdm4dQ3U2K5 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Kdm4dQ3U2K5 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Kdm4dQ3U2K5 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Kdm4dQ3U2K5 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Kdm4dQ3U2K5 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Kdm4dQ3U2K5 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Kdm4dQ3U2K5 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Kdm4dQ3U2K5 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Kdm4dQ3U2K5 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Kdm4dQ3U2K5 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Kdm4dQ3U2K5 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Kdm4dQ3U2K5 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Kdm4dQ3U2K5 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Kdm4dQ3U2K5 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Kdm4dQ3U2K5 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Kdm4dQ3U2K5 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Kdm4dQ3U2K5 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Kdm4dQ3U2K5 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Kdm4dQ3U2K5 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Kdm4dQ3U2K5 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Kdm4dQ3U2K5 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Kdm4dQ3U2K5 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Kdm4dQ3U2K5 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Kdm4dQ3U2K5 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Kdm4dQ3U2K5 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Kdm4dQ3U2K5 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Kdm4dQ3U2K5 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Kdm4dQ3U2K5 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Kdm4dQ3U2K5 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Kdm4dQ3U2K5 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Kdm4dQ3U2K5 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Kdm4dQ3U2K5 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Kdm4dQ3U2K5 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Kdm4dQ3U2K5 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Kdm4dQ3U2K5 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Kdm4dQ3U2K5 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Kdm4dQ3U2K5 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Kdm4dQ3U2K5 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kdm4dQ3U2K5 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kdm4dQ3U2K5 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kdm4dQ3U2K5 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kdm4dQ3U2K5 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kdm4dQ3U2K5 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kdm4dQ3U2K5 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Kdm4dQ3U2K5 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kdm4dQ3U2K5 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kdm4dQ3U2K5 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kdm4dQ3U2K5 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kdm4dQ3U2K5 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kdm4dQ3U2K5 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kdm4dQ3U2K5 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Kdm4dQ3U2K5 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kdm4dQ3U2K5 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kdm4dQ3U2K5 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kdm4dQ3U2K5 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kdm4dQ3U2K5 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kdm4dQ3U2K5 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kdm4dQ3U2K5 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kdm4dQ3U2K5 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kdm4dQ3U2K5 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kdm4dQ3U2K5 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kdm4dQ3U2K5 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kdm4dQ3U2K5 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Kdm4dQ3U2K5 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kdm4dQ3U2K5 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kdm4dQ3U2K5 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kdm4dQ3U2K5 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kdm4dQ3U2K5 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
Kdm4dQ3U2K5 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kdm4dQ3U2K5 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kdm4dQ3U2K5 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kdm4dQ3U2K5 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.7 ms