Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0J8

Tbc1d2b, TBC1 domain family member 2B, mousemouse

Predictions only

Length 965 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbc1d2bQ3U0J8 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Tbc1d2bQ3U0J8 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Tbc1d2bQ3U0J8 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Tbc1d2bQ3U0J8 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Tbc1d2bQ3U0J8 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Tbc1d2bQ3U0J8 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Tbc1d2bQ3U0J8 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Tbc1d2bQ3U0J8 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Tbc1d2bQ3U0J8 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Tbc1d2bQ3U0J8 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Tbc1d2bQ3U0J8 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Tbc1d2bQ3U0J8 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Tbc1d2bQ3U0J8 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Tbc1d2bQ3U0J8 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Tbc1d2bQ3U0J8 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Tbc1d2bQ3U0J8 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Tbc1d2bQ3U0J8 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Tbc1d2bQ3U0J8 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Tbc1d2bQ3U0J8 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Tbc1d2bQ3U0J8 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Tbc1d2bQ3U0J8 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Tbc1d2bQ3U0J8 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Tbc1d2bQ3U0J8 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Tbc1d2bQ3U0J8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Tbc1d2bQ3U0J8 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Tbc1d2bQ3U0J8 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Tbc1d2bQ3U0J8 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Tbc1d2bQ3U0J8 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Tbc1d2bQ3U0J8 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Tbc1d2bQ3U0J8 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Tbc1d2bQ3U0J8 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Tbc1d2bQ3U0J8 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Tbc1d2bQ3U0J8 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Tbc1d2bQ3U0J8 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Tbc1d2bQ3U0J8 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Tbc1d2bQ3U0J8 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Tbc1d2bQ3U0J8 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Tbc1d2bQ3U0J8 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Tbc1d2bQ3U0J8 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Tbc1d2bQ3U0J8 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Tbc1d2bQ3U0J8 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Tbc1d2bQ3U0J8 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Tbc1d2bQ3U0J8 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Tbc1d2bQ3U0J8 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Tbc1d2bQ3U0J8 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Tbc1d2bQ3U0J8 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Tbc1d2bQ3U0J8 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Tbc1d2bQ3U0J8 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Tbc1d2bQ3U0J8 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Tbc1d2bQ3U0J8 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Tbc1d2bQ3U0J8 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Tbc1d2bQ3U0J8 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Tbc1d2bQ3U0J8 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Tbc1d2bQ3U0J8 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Tbc1d2bQ3U0J8 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Tbc1d2bQ3U0J8 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Tbc1d2bQ3U0J8 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Tbc1d2bQ3U0J8 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Tbc1d2bQ3U0J8 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Tbc1d2bQ3U0J8 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Tbc1d2bQ3U0J8 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Tbc1d2bQ3U0J8 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Tbc1d2bQ3U0J8 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Tbc1d2bQ3U0J8 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Tbc1d2bQ3U0J8 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms