Protein–RNA interactions for Protein: Q3TRM4

Pnpla6, Neuropathy target esterase, mousemouse

Predictions only

Length 1,355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnpla6Q3TRM4 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Pnpla6Q3TRM4 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Pnpla6Q3TRM4 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Pnpla6Q3TRM4 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Pnpla6Q3TRM4 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Pnpla6Q3TRM4 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Pnpla6Q3TRM4 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Pnpla6Q3TRM4 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Pnpla6Q3TRM4 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Pnpla6Q3TRM4 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Pnpla6Q3TRM4 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Pnpla6Q3TRM4 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Pnpla6Q3TRM4 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Pnpla6Q3TRM4 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Pnpla6Q3TRM4 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Pnpla6Q3TRM4 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Pnpla6Q3TRM4 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Pnpla6Q3TRM4 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Pnpla6Q3TRM4 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Pnpla6Q3TRM4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Pnpla6Q3TRM4 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Pnpla6Q3TRM4 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Pnpla6Q3TRM4 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Pnpla6Q3TRM4 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Pnpla6Q3TRM4 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Pnpla6Q3TRM4 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Pnpla6Q3TRM4 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Pnpla6Q3TRM4 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Pnpla6Q3TRM4 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Pnpla6Q3TRM4 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Pnpla6Q3TRM4 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Pnpla6Q3TRM4 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Pnpla6Q3TRM4 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Pnpla6Q3TRM4 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Pnpla6Q3TRM4 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Pnpla6Q3TRM4 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Pnpla6Q3TRM4 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Pnpla6Q3TRM4 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Pnpla6Q3TRM4 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Pnpla6Q3TRM4 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Pnpla6Q3TRM4 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Pnpla6Q3TRM4 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Pnpla6Q3TRM4 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Pnpla6Q3TRM4 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Pnpla6Q3TRM4 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Pnpla6Q3TRM4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Pnpla6Q3TRM4 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Pnpla6Q3TRM4 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Pnpla6Q3TRM4 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Pnpla6Q3TRM4 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Pnpla6Q3TRM4 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Pnpla6Q3TRM4 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Pnpla6Q3TRM4 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Pnpla6Q3TRM4 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Pnpla6Q3TRM4 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Pnpla6Q3TRM4 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Pnpla6Q3TRM4 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Pnpla6Q3TRM4 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Pnpla6Q3TRM4 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Pnpla6Q3TRM4 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Pnpla6Q3TRM4 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Pnpla6Q3TRM4 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Pnpla6Q3TRM4 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
Pnpla6Q3TRM4 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Pnpla6Q3TRM4 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Pnpla6Q3TRM4 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Pnpla6Q3TRM4 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Pnpla6Q3TRM4 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Pnpla6Q3TRM4 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Pnpla6Q3TRM4 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Pnpla6Q3TRM4 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Pnpla6Q3TRM4 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Pnpla6Q3TRM4 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Pnpla6Q3TRM4 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Pnpla6Q3TRM4 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Pnpla6Q3TRM4 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Pnpla6Q3TRM4 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Pnpla6Q3TRM4 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Pnpla6Q3TRM4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Pnpla6Q3TRM4 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Pnpla6Q3TRM4 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Pnpla6Q3TRM4 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Pnpla6Q3TRM4 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Pnpla6Q3TRM4 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Pnpla6Q3TRM4 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Pnpla6Q3TRM4 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Pnpla6Q3TRM4 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Pnpla6Q3TRM4 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Pnpla6Q3TRM4 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Pnpla6Q3TRM4 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Pnpla6Q3TRM4 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Pnpla6Q3TRM4 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Pnpla6Q3TRM4 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Pnpla6Q3TRM4 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Pnpla6Q3TRM4 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Pnpla6Q3TRM4 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Pnpla6Q3TRM4 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Pnpla6Q3TRM4 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Pnpla6Q3TRM4 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Pnpla6Q3TRM4 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms