Protein–RNA interactions for Protein: Q3TQ03

Ciart, Circadian-associated transcriptional repressor, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CiartQ3TQ03 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CiartQ3TQ03 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CiartQ3TQ03 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CiartQ3TQ03 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CiartQ3TQ03 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CiartQ3TQ03 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CiartQ3TQ03 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CiartQ3TQ03 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CiartQ3TQ03 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CiartQ3TQ03 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CiartQ3TQ03 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CiartQ3TQ03 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CiartQ3TQ03 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CiartQ3TQ03 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CiartQ3TQ03 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CiartQ3TQ03 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CiartQ3TQ03 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CiartQ3TQ03 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CiartQ3TQ03 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CiartQ3TQ03 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CiartQ3TQ03 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CiartQ3TQ03 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CiartQ3TQ03 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CiartQ3TQ03 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CiartQ3TQ03 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CiartQ3TQ03 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CiartQ3TQ03 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CiartQ3TQ03 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CiartQ3TQ03 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CiartQ3TQ03 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CiartQ3TQ03 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CiartQ3TQ03 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CiartQ3TQ03 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CiartQ3TQ03 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CiartQ3TQ03 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CiartQ3TQ03 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CiartQ3TQ03 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CiartQ3TQ03 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CiartQ3TQ03 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CiartQ3TQ03 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CiartQ3TQ03 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CiartQ3TQ03 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CiartQ3TQ03 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CiartQ3TQ03 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CiartQ3TQ03 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CiartQ3TQ03 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CiartQ3TQ03 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CiartQ3TQ03 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CiartQ3TQ03 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CiartQ3TQ03 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CiartQ3TQ03 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CiartQ3TQ03 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CiartQ3TQ03 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CiartQ3TQ03 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CiartQ3TQ03 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CiartQ3TQ03 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CiartQ3TQ03 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CiartQ3TQ03 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CiartQ3TQ03 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CiartQ3TQ03 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CiartQ3TQ03 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CiartQ3TQ03 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CiartQ3TQ03 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CiartQ3TQ03 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CiartQ3TQ03 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CiartQ3TQ03 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CiartQ3TQ03 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CiartQ3TQ03 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CiartQ3TQ03 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CiartQ3TQ03 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CiartQ3TQ03 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CiartQ3TQ03 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CiartQ3TQ03 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CiartQ3TQ03 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CiartQ3TQ03 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CiartQ3TQ03 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CiartQ3TQ03 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CiartQ3TQ03 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CiartQ3TQ03 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CiartQ3TQ03 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CiartQ3TQ03 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CiartQ3TQ03 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CiartQ3TQ03 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CiartQ3TQ03 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CiartQ3TQ03 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CiartQ3TQ03 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CiartQ3TQ03 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CiartQ3TQ03 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CiartQ3TQ03 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CiartQ3TQ03 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CiartQ3TQ03 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CiartQ3TQ03 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CiartQ3TQ03 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CiartQ3TQ03 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CiartQ3TQ03 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CiartQ3TQ03 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CiartQ3TQ03 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CiartQ3TQ03 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CiartQ3TQ03 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CiartQ3TQ03 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms