Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYJ2

Prr27, 4930432K09Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr27Q3SYJ2 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Prr27Q3SYJ2 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Prr27Q3SYJ2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Prr27Q3SYJ2 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Prr27Q3SYJ2 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Prr27Q3SYJ2 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Prr27Q3SYJ2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Prr27Q3SYJ2 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Prr27Q3SYJ2 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Prr27Q3SYJ2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Prr27Q3SYJ2 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Prr27Q3SYJ2 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Prr27Q3SYJ2 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Prr27Q3SYJ2 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Prr27Q3SYJ2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Prr27Q3SYJ2 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Prr27Q3SYJ2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Prr27Q3SYJ2 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Prr27Q3SYJ2 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Prr27Q3SYJ2 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Prr27Q3SYJ2 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Prr27Q3SYJ2 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Prr27Q3SYJ2 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Prr27Q3SYJ2 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Prr27Q3SYJ2 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Prr27Q3SYJ2 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Prr27Q3SYJ2 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Prr27Q3SYJ2 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Prr27Q3SYJ2 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Prr27Q3SYJ2 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Prr27Q3SYJ2 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Prr27Q3SYJ2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Prr27Q3SYJ2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Prr27Q3SYJ2 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Prr27Q3SYJ2 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Prr27Q3SYJ2 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Prr27Q3SYJ2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Prr27Q3SYJ2 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Prr27Q3SYJ2 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Prr27Q3SYJ2 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Prr27Q3SYJ2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Prr27Q3SYJ2 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Prr27Q3SYJ2 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Prr27Q3SYJ2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Prr27Q3SYJ2 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Prr27Q3SYJ2 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Prr27Q3SYJ2 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Prr27Q3SYJ2 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Prr27Q3SYJ2 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Prr27Q3SYJ2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Prr27Q3SYJ2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Prr27Q3SYJ2 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Prr27Q3SYJ2 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Prr27Q3SYJ2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Prr27Q3SYJ2 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Prr27Q3SYJ2 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Prr27Q3SYJ2 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Prr27Q3SYJ2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Prr27Q3SYJ2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Prr27Q3SYJ2 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Prr27Q3SYJ2 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Prr27Q3SYJ2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Prr27Q3SYJ2 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Prr27Q3SYJ2 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Prr27Q3SYJ2 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Prr27Q3SYJ2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Prr27Q3SYJ2 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Prr27Q3SYJ2 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Prr27Q3SYJ2 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Prr27Q3SYJ2 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Prr27Q3SYJ2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Prr27Q3SYJ2 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Prr27Q3SYJ2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Prr27Q3SYJ2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Prr27Q3SYJ2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Prr27Q3SYJ2 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Prr27Q3SYJ2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Prr27Q3SYJ2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Prr27Q3SYJ2 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Prr27Q3SYJ2 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Prr27Q3SYJ2 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Prr27Q3SYJ2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Prr27Q3SYJ2 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Prr27Q3SYJ2 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Prr27Q3SYJ2 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Prr27Q3SYJ2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Prr27Q3SYJ2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Prr27Q3SYJ2 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Prr27Q3SYJ2 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Prr27Q3SYJ2 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Prr27Q3SYJ2 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Prr27Q3SYJ2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Prr27Q3SYJ2 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Prr27Q3SYJ2 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Prr27Q3SYJ2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Prr27Q3SYJ2 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Prr27Q3SYJ2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Prr27Q3SYJ2 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Prr27Q3SYJ2 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Prr27Q3SYJ2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms