Protein–RNA interactions for Protein: Q3LS21

Kcnk9, Potassium channel subfamily K member 9, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnk9Q3LS21 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kcnk9Q3LS21 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kcnk9Q3LS21 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kcnk9Q3LS21 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kcnk9Q3LS21 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kcnk9Q3LS21 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kcnk9Q3LS21 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kcnk9Q3LS21 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kcnk9Q3LS21 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kcnk9Q3LS21 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Kcnk9Q3LS21 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Kcnk9Q3LS21 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Kcnk9Q3LS21 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Kcnk9Q3LS21 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kcnk9Q3LS21 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kcnk9Q3LS21 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kcnk9Q3LS21 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kcnk9Q3LS21 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kcnk9Q3LS21 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kcnk9Q3LS21 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kcnk9Q3LS21 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kcnk9Q3LS21 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kcnk9Q3LS21 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kcnk9Q3LS21 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kcnk9Q3LS21 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kcnk9Q3LS21 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kcnk9Q3LS21 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kcnk9Q3LS21 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Kcnk9Q3LS21 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kcnk9Q3LS21 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kcnk9Q3LS21 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kcnk9Q3LS21 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kcnk9Q3LS21 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Kcnk9Q3LS21 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Kcnk9Q3LS21 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Kcnk9Q3LS21 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Kcnk9Q3LS21 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kcnk9Q3LS21 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kcnk9Q3LS21 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kcnk9Q3LS21 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kcnk9Q3LS21 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kcnk9Q3LS21 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kcnk9Q3LS21 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kcnk9Q3LS21 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kcnk9Q3LS21 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Kcnk9Q3LS21 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Kcnk9Q3LS21 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Kcnk9Q3LS21 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Kcnk9Q3LS21 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Kcnk9Q3LS21 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Kcnk9Q3LS21 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Kcnk9Q3LS21 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Kcnk9Q3LS21 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Kcnk9Q3LS21 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Kcnk9Q3LS21 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Kcnk9Q3LS21 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Kcnk9Q3LS21 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Kcnk9Q3LS21 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Kcnk9Q3LS21 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Kcnk9Q3LS21 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kcnk9Q3LS21 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kcnk9Q3LS21 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kcnk9Q3LS21 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Kcnk9Q3LS21 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Kcnk9Q3LS21 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Kcnk9Q3LS21 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Kcnk9Q3LS21 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Kcnk9Q3LS21 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Kcnk9Q3LS21 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Kcnk9Q3LS21 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Kcnk9Q3LS21 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Kcnk9Q3LS21 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Kcnk9Q3LS21 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Kcnk9Q3LS21 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Kcnk9Q3LS21 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Kcnk9Q3LS21 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Kcnk9Q3LS21 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Kcnk9Q3LS21 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Kcnk9Q3LS21 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Kcnk9Q3LS21 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Kcnk9Q3LS21 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Kcnk9Q3LS21 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Kcnk9Q3LS21 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Kcnk9Q3LS21 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Kcnk9Q3LS21 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Kcnk9Q3LS21 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Kcnk9Q3LS21 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Kcnk9Q3LS21 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Kcnk9Q3LS21 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Kcnk9Q3LS21 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Kcnk9Q3LS21 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Kcnk9Q3LS21 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Kcnk9Q3LS21 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Kcnk9Q3LS21 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Kcnk9Q3LS21 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Kcnk9Q3LS21 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Kcnk9Q3LS21 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Kcnk9Q3LS21 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Kcnk9Q3LS21 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Kcnk9Q3LS21 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.4 ms