Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNL4

UPF0728 protein C10orf53 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3KNL4 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Q3KNL4 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Q3KNL4 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Q3KNL4 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Q3KNL4 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Q3KNL4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Q3KNL4 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Q3KNL4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Q3KNL4 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Q3KNL4 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Q3KNL4 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Q3KNL4 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Q3KNL4 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Q3KNL4 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Q3KNL4 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Q3KNL4 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Q3KNL4 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Q3KNL4 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Q3KNL4 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Q3KNL4 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Q3KNL4 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Q3KNL4 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Q3KNL4 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Q3KNL4 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Q3KNL4 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Q3KNL4 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Q3KNL4 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Q3KNL4 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Q3KNL4 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Q3KNL4 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Q3KNL4 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Q3KNL4 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Q3KNL4 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Q3KNL4 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Q3KNL4 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Q3KNL4 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Q3KNL4 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Q3KNL4 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Q3KNL4 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Q3KNL4 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Q3KNL4 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Q3KNL4 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Q3KNL4 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q3KNL4 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q3KNL4 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q3KNL4 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q3KNL4 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q3KNL4 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Q3KNL4 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Q3KNL4 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Q3KNL4 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Q3KNL4 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Q3KNL4 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Q3KNL4 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Q3KNL4 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Q3KNL4 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Q3KNL4 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Q3KNL4 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Q3KNL4 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Q3KNL4 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Q3KNL4 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Q3KNL4 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Q3KNL4 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Q3KNL4 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Q3KNL4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Q3KNL4 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Q3KNL4 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Q3KNL4 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Q3KNL4 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Q3KNL4 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Q3KNL4 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Q3KNL4 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Q3KNL4 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Q3KNL4 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Q3KNL4 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Q3KNL4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q3KNL4 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q3KNL4 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q3KNL4 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q3KNL4 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Q3KNL4 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Q3KNL4 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Q3KNL4 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Q3KNL4 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Q3KNL4 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Q3KNL4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Q3KNL4 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Q3KNL4 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Q3KNL4 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Q3KNL4 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Q3KNL4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Q3KNL4 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Q3KNL4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Q3KNL4 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Q3KNL4 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Q3KNL4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Q3KNL4 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Q3KNL4 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Q3KNL4 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Q3KNL4 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 243.7 ms