Protein–RNA interactions for Protein: Q31093

H2-M3, Histocompatibility 2, M region locus 3, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M3Q31093 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
H2-M3Q31093 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
H2-M3Q31093 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
H2-M3Q31093 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
H2-M3Q31093 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
H2-M3Q31093 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
H2-M3Q31093 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
H2-M3Q31093 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
H2-M3Q31093 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
H2-M3Q31093 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
H2-M3Q31093 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
H2-M3Q31093 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
H2-M3Q31093 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
H2-M3Q31093 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
H2-M3Q31093 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
H2-M3Q31093 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
H2-M3Q31093 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
H2-M3Q31093 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
H2-M3Q31093 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
H2-M3Q31093 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
H2-M3Q31093 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
H2-M3Q31093 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
H2-M3Q31093 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
H2-M3Q31093 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
H2-M3Q31093 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
H2-M3Q31093 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
H2-M3Q31093 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
H2-M3Q31093 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
H2-M3Q31093 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
H2-M3Q31093 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
H2-M3Q31093 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
H2-M3Q31093 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
H2-M3Q31093 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
H2-M3Q31093 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
H2-M3Q31093 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
H2-M3Q31093 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
H2-M3Q31093 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
H2-M3Q31093 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
H2-M3Q31093 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
H2-M3Q31093 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
H2-M3Q31093 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
H2-M3Q31093 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
H2-M3Q31093 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
H2-M3Q31093 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
H2-M3Q31093 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
H2-M3Q31093 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
H2-M3Q31093 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
H2-M3Q31093 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
H2-M3Q31093 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
H2-M3Q31093 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
H2-M3Q31093 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
H2-M3Q31093 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
H2-M3Q31093 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
H2-M3Q31093 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
H2-M3Q31093 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
H2-M3Q31093 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
H2-M3Q31093 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
H2-M3Q31093 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
H2-M3Q31093 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
H2-M3Q31093 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
H2-M3Q31093 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
H2-M3Q31093 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
H2-M3Q31093 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
H2-M3Q31093 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
H2-M3Q31093 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
H2-M3Q31093 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
H2-M3Q31093 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
H2-M3Q31093 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
H2-M3Q31093 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
H2-M3Q31093 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
H2-M3Q31093 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
H2-M3Q31093 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
H2-M3Q31093 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
H2-M3Q31093 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
H2-M3Q31093 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
H2-M3Q31093 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
H2-M3Q31093 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
H2-M3Q31093 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
H2-M3Q31093 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
H2-M3Q31093 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
H2-M3Q31093 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
H2-M3Q31093 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
H2-M3Q31093 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
H2-M3Q31093 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
H2-M3Q31093 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
H2-M3Q31093 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
H2-M3Q31093 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
H2-M3Q31093 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
H2-M3Q31093 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
H2-M3Q31093 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
H2-M3Q31093 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
H2-M3Q31093 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
H2-M3Q31093 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
H2-M3Q31093 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
H2-M3Q31093 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
H2-M3Q31093 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
H2-M3Q31093 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
H2-M3Q31093 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
H2-M3Q31093 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
H2-M3Q31093 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms