Protein–RNA interactions for Protein: Q30D77

Col24a1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col24a1Q30D77 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Col24a1Q30D77 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Col24a1Q30D77 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Col24a1Q30D77 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Col24a1Q30D77 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Col24a1Q30D77 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
Col24a1Q30D77 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Col24a1Q30D77 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC29.14■■■□□ 2.25
Col24a1Q30D77 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Col24a1Q30D77 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Col24a1Q30D77 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Col24a1Q30D77 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Col24a1Q30D77 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Col24a1Q30D77 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Col24a1Q30D77 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Col24a1Q30D77 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Col24a1Q30D77 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Col24a1Q30D77 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Col24a1Q30D77 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Col24a1Q30D77 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Col24a1Q30D77 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Col24a1Q30D77 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
Col24a1Q30D77 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
Col24a1Q30D77 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Col24a1Q30D77 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Col24a1Q30D77 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Col24a1Q30D77 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Col24a1Q30D77 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Col24a1Q30D77 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Col24a1Q30D77 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Col24a1Q30D77 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Col24a1Q30D77 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Col24a1Q30D77 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Col24a1Q30D77 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Col24a1Q30D77 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Col24a1Q30D77 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Col24a1Q30D77 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Col24a1Q30D77 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Col24a1Q30D77 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Col24a1Q30D77 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Col24a1Q30D77 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Col24a1Q30D77 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Col24a1Q30D77 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Col24a1Q30D77 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Col24a1Q30D77 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Col24a1Q30D77 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Col24a1Q30D77 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Col24a1Q30D77 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Col24a1Q30D77 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Col24a1Q30D77 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Col24a1Q30D77 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Col24a1Q30D77 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Col24a1Q30D77 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Col24a1Q30D77 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Col24a1Q30D77 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Col24a1Q30D77 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Col24a1Q30D77 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Col24a1Q30D77 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Col24a1Q30D77 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Col24a1Q30D77 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
Col24a1Q30D77 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Col24a1Q30D77 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Col24a1Q30D77 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Col24a1Q30D77 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Col24a1Q30D77 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Col24a1Q30D77 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Col24a1Q30D77 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Col24a1Q30D77 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Col24a1Q30D77 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Col24a1Q30D77 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Col24a1Q30D77 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Col24a1Q30D77 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Col24a1Q30D77 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Col24a1Q30D77 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Col24a1Q30D77 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Col24a1Q30D77 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Col24a1Q30D77 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Col24a1Q30D77 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Col24a1Q30D77 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Col24a1Q30D77 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Col24a1Q30D77 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Col24a1Q30D77 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Col24a1Q30D77 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Col24a1Q30D77 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Col24a1Q30D77 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Col24a1Q30D77 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Col24a1Q30D77 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Col24a1Q30D77 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Col24a1Q30D77 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Col24a1Q30D77 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Col24a1Q30D77 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Col24a1Q30D77 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Col24a1Q30D77 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Col24a1Q30D77 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Col24a1Q30D77 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Col24a1Q30D77 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Col24a1Q30D77 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
Col24a1Q30D77 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Col24a1Q30D77 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Col24a1Q30D77 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms