Protein–RNA interactions for Protein: Q307W7

Kncn, Kinocilin, mousemouse

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KncnQ307W7 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KncnQ307W7 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KncnQ307W7 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KncnQ307W7 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KncnQ307W7 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KncnQ307W7 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KncnQ307W7 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KncnQ307W7 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KncnQ307W7 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KncnQ307W7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KncnQ307W7 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KncnQ307W7 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KncnQ307W7 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KncnQ307W7 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KncnQ307W7 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KncnQ307W7 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KncnQ307W7 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KncnQ307W7 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KncnQ307W7 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KncnQ307W7 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KncnQ307W7 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KncnQ307W7 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KncnQ307W7 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KncnQ307W7 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KncnQ307W7 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KncnQ307W7 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KncnQ307W7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KncnQ307W7 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KncnQ307W7 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KncnQ307W7 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KncnQ307W7 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KncnQ307W7 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KncnQ307W7 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KncnQ307W7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KncnQ307W7 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KncnQ307W7 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KncnQ307W7 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KncnQ307W7 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KncnQ307W7 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KncnQ307W7 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KncnQ307W7 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KncnQ307W7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KncnQ307W7 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KncnQ307W7 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KncnQ307W7 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KncnQ307W7 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KncnQ307W7 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
KncnQ307W7 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KncnQ307W7 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KncnQ307W7 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KncnQ307W7 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KncnQ307W7 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KncnQ307W7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KncnQ307W7 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KncnQ307W7 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KncnQ307W7 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KncnQ307W7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KncnQ307W7 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
KncnQ307W7 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KncnQ307W7 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KncnQ307W7 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KncnQ307W7 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
KncnQ307W7 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KncnQ307W7 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KncnQ307W7 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KncnQ307W7 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KncnQ307W7 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KncnQ307W7 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KncnQ307W7 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KncnQ307W7 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KncnQ307W7 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KncnQ307W7 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KncnQ307W7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KncnQ307W7 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KncnQ307W7 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KncnQ307W7 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KncnQ307W7 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KncnQ307W7 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
KncnQ307W7 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KncnQ307W7 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KncnQ307W7 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KncnQ307W7 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KncnQ307W7 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KncnQ307W7 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KncnQ307W7 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KncnQ307W7 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KncnQ307W7 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KncnQ307W7 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KncnQ307W7 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KncnQ307W7 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KncnQ307W7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KncnQ307W7 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KncnQ307W7 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KncnQ307W7 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KncnQ307W7 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KncnQ307W7 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KncnQ307W7 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KncnQ307W7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KncnQ307W7 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KncnQ307W7 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms