Protein–RNA interactions for Protein: Q2V6D6

Gbp8, Guanylate-binding protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp8Q2V6D6 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Gbp8Q2V6D6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Gbp8Q2V6D6 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gbp8Q2V6D6 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gbp8Q2V6D6 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gbp8Q2V6D6 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gbp8Q2V6D6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gbp8Q2V6D6 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Gbp8Q2V6D6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gbp8Q2V6D6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gbp8Q2V6D6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gbp8Q2V6D6 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gbp8Q2V6D6 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gbp8Q2V6D6 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gbp8Q2V6D6 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gbp8Q2V6D6 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Gbp8Q2V6D6 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Gbp8Q2V6D6 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Gbp8Q2V6D6 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gbp8Q2V6D6 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gbp8Q2V6D6 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gbp8Q2V6D6 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gbp8Q2V6D6 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gbp8Q2V6D6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gbp8Q2V6D6 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Gbp8Q2V6D6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gbp8Q2V6D6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gbp8Q2V6D6 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gbp8Q2V6D6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gbp8Q2V6D6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gbp8Q2V6D6 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gbp8Q2V6D6 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gbp8Q2V6D6 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gbp8Q2V6D6 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gbp8Q2V6D6 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gbp8Q2V6D6 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gbp8Q2V6D6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gbp8Q2V6D6 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Gbp8Q2V6D6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Gbp8Q2V6D6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Gbp8Q2V6D6 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gbp8Q2V6D6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gbp8Q2V6D6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gbp8Q2V6D6 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gbp8Q2V6D6 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gbp8Q2V6D6 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gbp8Q2V6D6 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gbp8Q2V6D6 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gbp8Q2V6D6 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gbp8Q2V6D6 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gbp8Q2V6D6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gbp8Q2V6D6 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Gbp8Q2V6D6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gbp8Q2V6D6 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gbp8Q2V6D6 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gbp8Q2V6D6 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gbp8Q2V6D6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gbp8Q2V6D6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gbp8Q2V6D6 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gbp8Q2V6D6 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gbp8Q2V6D6 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gbp8Q2V6D6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gbp8Q2V6D6 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gbp8Q2V6D6 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gbp8Q2V6D6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gbp8Q2V6D6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gbp8Q2V6D6 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gbp8Q2V6D6 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gbp8Q2V6D6 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gbp8Q2V6D6 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gbp8Q2V6D6 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gbp8Q2V6D6 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gbp8Q2V6D6 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gbp8Q2V6D6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gbp8Q2V6D6 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gbp8Q2V6D6 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gbp8Q2V6D6 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gbp8Q2V6D6 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gbp8Q2V6D6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gbp8Q2V6D6 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gbp8Q2V6D6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gbp8Q2V6D6 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gbp8Q2V6D6 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gbp8Q2V6D6 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gbp8Q2V6D6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gbp8Q2V6D6 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gbp8Q2V6D6 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gbp8Q2V6D6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gbp8Q2V6D6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gbp8Q2V6D6 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Gbp8Q2V6D6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gbp8Q2V6D6 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gbp8Q2V6D6 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gbp8Q2V6D6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gbp8Q2V6D6 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gbp8Q2V6D6 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gbp8Q2V6D6 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gbp8Q2V6D6 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gbp8Q2V6D6 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gbp8Q2V6D6 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms