Protein–RNA interactions for Protein: Q1HCM0

Fgfbp3, Fibroblast growth factor-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgfbp3Q1HCM0 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fgfbp3Q1HCM0 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fgfbp3Q1HCM0 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fgfbp3Q1HCM0 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fgfbp3Q1HCM0 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Fgfbp3Q1HCM0 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Fgfbp3Q1HCM0 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fgfbp3Q1HCM0 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fgfbp3Q1HCM0 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fgfbp3Q1HCM0 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fgfbp3Q1HCM0 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fgfbp3Q1HCM0 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fgfbp3Q1HCM0 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fgfbp3Q1HCM0 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fgfbp3Q1HCM0 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fgfbp3Q1HCM0 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fgfbp3Q1HCM0 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fgfbp3Q1HCM0 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fgfbp3Q1HCM0 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fgfbp3Q1HCM0 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fgfbp3Q1HCM0 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Fgfbp3Q1HCM0 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Fgfbp3Q1HCM0 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Fgfbp3Q1HCM0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Fgfbp3Q1HCM0 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fgfbp3Q1HCM0 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fgfbp3Q1HCM0 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fgfbp3Q1HCM0 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fgfbp3Q1HCM0 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Fgfbp3Q1HCM0 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fgfbp3Q1HCM0 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fgfbp3Q1HCM0 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fgfbp3Q1HCM0 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fgfbp3Q1HCM0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fgfbp3Q1HCM0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fgfbp3Q1HCM0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fgfbp3Q1HCM0 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fgfbp3Q1HCM0 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fgfbp3Q1HCM0 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fgfbp3Q1HCM0 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fgfbp3Q1HCM0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fgfbp3Q1HCM0 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fgfbp3Q1HCM0 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fgfbp3Q1HCM0 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fgfbp3Q1HCM0 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Fgfbp3Q1HCM0 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fgfbp3Q1HCM0 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fgfbp3Q1HCM0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fgfbp3Q1HCM0 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fgfbp3Q1HCM0 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fgfbp3Q1HCM0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fgfbp3Q1HCM0 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fgfbp3Q1HCM0 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fgfbp3Q1HCM0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fgfbp3Q1HCM0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fgfbp3Q1HCM0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fgfbp3Q1HCM0 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Fgfbp3Q1HCM0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fgfbp3Q1HCM0 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fgfbp3Q1HCM0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fgfbp3Q1HCM0 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fgfbp3Q1HCM0 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fgfbp3Q1HCM0 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fgfbp3Q1HCM0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fgfbp3Q1HCM0 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fgfbp3Q1HCM0 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Fgfbp3Q1HCM0 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fgfbp3Q1HCM0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fgfbp3Q1HCM0 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fgfbp3Q1HCM0 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fgfbp3Q1HCM0 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fgfbp3Q1HCM0 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fgfbp3Q1HCM0 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fgfbp3Q1HCM0 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fgfbp3Q1HCM0 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fgfbp3Q1HCM0 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fgfbp3Q1HCM0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fgfbp3Q1HCM0 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fgfbp3Q1HCM0 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Fgfbp3Q1HCM0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Fgfbp3Q1HCM0 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Fgfbp3Q1HCM0 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fgfbp3Q1HCM0 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fgfbp3Q1HCM0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fgfbp3Q1HCM0 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fgfbp3Q1HCM0 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fgfbp3Q1HCM0 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fgfbp3Q1HCM0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fgfbp3Q1HCM0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fgfbp3Q1HCM0 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Fgfbp3Q1HCM0 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fgfbp3Q1HCM0 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fgfbp3Q1HCM0 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fgfbp3Q1HCM0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fgfbp3Q1HCM0 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fgfbp3Q1HCM0 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fgfbp3Q1HCM0 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fgfbp3Q1HCM0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fgfbp3Q1HCM0 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fgfbp3Q1HCM0 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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