Protein–RNA interactions for Protein: Q14C51

Ptcd3, Pentatricopeptide repeat domain-containing protein 3, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptcd3Q14C51 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ptcd3Q14C51 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ptcd3Q14C51 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ptcd3Q14C51 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ptcd3Q14C51 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ptcd3Q14C51 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ptcd3Q14C51 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ptcd3Q14C51 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ptcd3Q14C51 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Ptcd3Q14C51 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ptcd3Q14C51 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ptcd3Q14C51 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Ptcd3Q14C51 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ptcd3Q14C51 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ptcd3Q14C51 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ptcd3Q14C51 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ptcd3Q14C51 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ptcd3Q14C51 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ptcd3Q14C51 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ptcd3Q14C51 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ptcd3Q14C51 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ptcd3Q14C51 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ptcd3Q14C51 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Ptcd3Q14C51 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ptcd3Q14C51 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ptcd3Q14C51 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Ptcd3Q14C51 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ptcd3Q14C51 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ptcd3Q14C51 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Ptcd3Q14C51 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ptcd3Q14C51 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ptcd3Q14C51 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ptcd3Q14C51 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ptcd3Q14C51 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ptcd3Q14C51 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ptcd3Q14C51 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ptcd3Q14C51 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ptcd3Q14C51 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ptcd3Q14C51 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ptcd3Q14C51 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ptcd3Q14C51 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ptcd3Q14C51 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ptcd3Q14C51 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ptcd3Q14C51 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ptcd3Q14C51 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ptcd3Q14C51 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ptcd3Q14C51 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ptcd3Q14C51 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ptcd3Q14C51 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ptcd3Q14C51 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ptcd3Q14C51 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ptcd3Q14C51 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ptcd3Q14C51 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ptcd3Q14C51 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ptcd3Q14C51 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ptcd3Q14C51 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ptcd3Q14C51 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ptcd3Q14C51 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ptcd3Q14C51 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ptcd3Q14C51 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ptcd3Q14C51 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ptcd3Q14C51 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ptcd3Q14C51 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ptcd3Q14C51 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ptcd3Q14C51 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ptcd3Q14C51 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ptcd3Q14C51 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ptcd3Q14C51 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ptcd3Q14C51 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Ptcd3Q14C51 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ptcd3Q14C51 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Ptcd3Q14C51 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ptcd3Q14C51 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ptcd3Q14C51 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ptcd3Q14C51 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ptcd3Q14C51 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ptcd3Q14C51 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ptcd3Q14C51 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ptcd3Q14C51 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ptcd3Q14C51 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ptcd3Q14C51 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ptcd3Q14C51 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ptcd3Q14C51 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ptcd3Q14C51 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ptcd3Q14C51 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ptcd3Q14C51 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ptcd3Q14C51 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Ptcd3Q14C51 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ptcd3Q14C51 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Ptcd3Q14C51 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ptcd3Q14C51 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ptcd3Q14C51 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ptcd3Q14C51 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ptcd3Q14C51 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ptcd3Q14C51 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ptcd3Q14C51 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ptcd3Q14C51 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ptcd3Q14C51 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ptcd3Q14C51 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ptcd3Q14C51 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms