Protein–RNA interactions for Protein: Q149F5

Tmem71, Transmembrane protein 71, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem71Q149F5 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tmem71Q149F5 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tmem71Q149F5 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tmem71Q149F5 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tmem71Q149F5 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tmem71Q149F5 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tmem71Q149F5 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tmem71Q149F5 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tmem71Q149F5 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tmem71Q149F5 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tmem71Q149F5 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tmem71Q149F5 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tmem71Q149F5 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Tmem71Q149F5 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Tmem71Q149F5 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tmem71Q149F5 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tmem71Q149F5 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tmem71Q149F5 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tmem71Q149F5 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tmem71Q149F5 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tmem71Q149F5 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tmem71Q149F5 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tmem71Q149F5 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tmem71Q149F5 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tmem71Q149F5 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tmem71Q149F5 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tmem71Q149F5 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tmem71Q149F5 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tmem71Q149F5 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tmem71Q149F5 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tmem71Q149F5 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tmem71Q149F5 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tmem71Q149F5 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tmem71Q149F5 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tmem71Q149F5 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tmem71Q149F5 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tmem71Q149F5 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tmem71Q149F5 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tmem71Q149F5 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tmem71Q149F5 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tmem71Q149F5 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tmem71Q149F5 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tmem71Q149F5 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tmem71Q149F5 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tmem71Q149F5 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tmem71Q149F5 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tmem71Q149F5 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tmem71Q149F5 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tmem71Q149F5 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tmem71Q149F5 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tmem71Q149F5 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tmem71Q149F5 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tmem71Q149F5 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tmem71Q149F5 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Tmem71Q149F5 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tmem71Q149F5 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tmem71Q149F5 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tmem71Q149F5 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Tmem71Q149F5 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tmem71Q149F5 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tmem71Q149F5 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tmem71Q149F5 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tmem71Q149F5 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tmem71Q149F5 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tmem71Q149F5 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tmem71Q149F5 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tmem71Q149F5 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tmem71Q149F5 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tmem71Q149F5 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tmem71Q149F5 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tmem71Q149F5 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tmem71Q149F5 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tmem71Q149F5 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tmem71Q149F5 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tmem71Q149F5 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tmem71Q149F5 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tmem71Q149F5 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Tmem71Q149F5 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tmem71Q149F5 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tmem71Q149F5 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tmem71Q149F5 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tmem71Q149F5 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tmem71Q149F5 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tmem71Q149F5 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tmem71Q149F5 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tmem71Q149F5 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tmem71Q149F5 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tmem71Q149F5 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tmem71Q149F5 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tmem71Q149F5 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tmem71Q149F5 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tmem71Q149F5 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Tmem71Q149F5 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tmem71Q149F5 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tmem71Q149F5 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tmem71Q149F5 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tmem71Q149F5 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tmem71Q149F5 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tmem71Q149F5 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tmem71Q149F5 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.6 ms