Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ttc39dQ0VF76 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ttc39dQ0VF76 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ttc39dQ0VF76 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ttc39dQ0VF76 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ttc39dQ0VF76 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ttc39dQ0VF76 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ttc39dQ0VF76 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ttc39dQ0VF76 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ttc39dQ0VF76 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ttc39dQ0VF76 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ttc39dQ0VF76 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ttc39dQ0VF76 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ttc39dQ0VF76 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ttc39dQ0VF76 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ttc39dQ0VF76 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ttc39dQ0VF76 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ttc39dQ0VF76 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ttc39dQ0VF76 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ttc39dQ0VF76 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ttc39dQ0VF76 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ttc39dQ0VF76 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ttc39dQ0VF76 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ttc39dQ0VF76 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ttc39dQ0VF76 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ttc39dQ0VF76 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ttc39dQ0VF76 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ttc39dQ0VF76 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ttc39dQ0VF76 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ttc39dQ0VF76 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ttc39dQ0VF76 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ttc39dQ0VF76 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ttc39dQ0VF76 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ttc39dQ0VF76 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ttc39dQ0VF76 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ttc39dQ0VF76 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ttc39dQ0VF76 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ttc39dQ0VF76 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ttc39dQ0VF76 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ttc39dQ0VF76 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ttc39dQ0VF76 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ttc39dQ0VF76 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ttc39dQ0VF76 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ttc39dQ0VF76 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ttc39dQ0VF76 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ttc39dQ0VF76 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ttc39dQ0VF76 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ttc39dQ0VF76 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ttc39dQ0VF76 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Ttc39dQ0VF76 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ttc39dQ0VF76 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ttc39dQ0VF76 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ttc39dQ0VF76 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ttc39dQ0VF76 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ttc39dQ0VF76 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ttc39dQ0VF76 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ttc39dQ0VF76 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Ttc39dQ0VF76 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ttc39dQ0VF76 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ttc39dQ0VF76 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ttc39dQ0VF76 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ttc39dQ0VF76 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ttc39dQ0VF76 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ttc39dQ0VF76 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ttc39dQ0VF76 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ttc39dQ0VF76 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ttc39dQ0VF76 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ttc39dQ0VF76 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ttc39dQ0VF76 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ttc39dQ0VF76 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ttc39dQ0VF76 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ttc39dQ0VF76 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ttc39dQ0VF76 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ttc39dQ0VF76 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ttc39dQ0VF76 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ttc39dQ0VF76 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ttc39dQ0VF76 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ttc39dQ0VF76 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ttc39dQ0VF76 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ttc39dQ0VF76 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ttc39dQ0VF76 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ttc39dQ0VF76 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ttc39dQ0VF76 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ttc39dQ0VF76 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ttc39dQ0VF76 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ttc39dQ0VF76 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ttc39dQ0VF76 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ttc39dQ0VF76 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ttc39dQ0VF76 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ttc39dQ0VF76 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ttc39dQ0VF76 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ttc39dQ0VF76 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ttc39dQ0VF76 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ttc39dQ0VF76 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ttc39dQ0VF76 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ttc39dQ0VF76 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ttc39dQ0VF76 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ttc39dQ0VF76 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ttc39dQ0VF76 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ttc39dQ0VF76 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms