Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBK2

Krt80, Keratin, type II cytoskeletal 80, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt80Q0VBK2 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Krt80Q0VBK2 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Krt80Q0VBK2 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Krt80Q0VBK2 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Krt80Q0VBK2 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Krt80Q0VBK2 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Krt80Q0VBK2 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Krt80Q0VBK2 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Krt80Q0VBK2 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Krt80Q0VBK2 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Krt80Q0VBK2 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Krt80Q0VBK2 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Krt80Q0VBK2 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Krt80Q0VBK2 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Krt80Q0VBK2 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Krt80Q0VBK2 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Krt80Q0VBK2 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Krt80Q0VBK2 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Krt80Q0VBK2 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Krt80Q0VBK2 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Krt80Q0VBK2 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Krt80Q0VBK2 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Krt80Q0VBK2 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Krt80Q0VBK2 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Krt80Q0VBK2 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Krt80Q0VBK2 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Krt80Q0VBK2 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Krt80Q0VBK2 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Krt80Q0VBK2 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Krt80Q0VBK2 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Krt80Q0VBK2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Krt80Q0VBK2 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Krt80Q0VBK2 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Krt80Q0VBK2 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Krt80Q0VBK2 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Krt80Q0VBK2 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Krt80Q0VBK2 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Krt80Q0VBK2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Krt80Q0VBK2 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Krt80Q0VBK2 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Krt80Q0VBK2 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Krt80Q0VBK2 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Krt80Q0VBK2 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Krt80Q0VBK2 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Krt80Q0VBK2 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Krt80Q0VBK2 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Krt80Q0VBK2 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Krt80Q0VBK2 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Krt80Q0VBK2 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Krt80Q0VBK2 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Krt80Q0VBK2 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Krt80Q0VBK2 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Krt80Q0VBK2 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Krt80Q0VBK2 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Krt80Q0VBK2 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Krt80Q0VBK2 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Krt80Q0VBK2 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Krt80Q0VBK2 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Krt80Q0VBK2 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Krt80Q0VBK2 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Krt80Q0VBK2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Krt80Q0VBK2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Krt80Q0VBK2 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Krt80Q0VBK2 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Krt80Q0VBK2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Krt80Q0VBK2 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Krt80Q0VBK2 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Krt80Q0VBK2 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Krt80Q0VBK2 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Krt80Q0VBK2 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Krt80Q0VBK2 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Krt80Q0VBK2 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Krt80Q0VBK2 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Krt80Q0VBK2 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Krt80Q0VBK2 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Krt80Q0VBK2 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Krt80Q0VBK2 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Krt80Q0VBK2 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Krt80Q0VBK2 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Krt80Q0VBK2 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Krt80Q0VBK2 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Krt80Q0VBK2 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Krt80Q0VBK2 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Krt80Q0VBK2 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Krt80Q0VBK2 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Krt80Q0VBK2 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Krt80Q0VBK2 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Krt80Q0VBK2 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Krt80Q0VBK2 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Krt80Q0VBK2 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Krt80Q0VBK2 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Krt80Q0VBK2 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Krt80Q0VBK2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Krt80Q0VBK2 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Krt80Q0VBK2 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Krt80Q0VBK2 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Krt80Q0VBK2 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Krt80Q0VBK2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Krt80Q0VBK2 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Krt80Q0VBK2 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms