Protein–RNA interactions for Protein: Q08874

Mitf, Microphthalmia-associated transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MitfQ08874 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MitfQ08874 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MitfQ08874 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MitfQ08874 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MitfQ08874 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MitfQ08874 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MitfQ08874 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MitfQ08874 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MitfQ08874 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MitfQ08874 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MitfQ08874 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MitfQ08874 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MitfQ08874 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MitfQ08874 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MitfQ08874 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MitfQ08874 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MitfQ08874 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MitfQ08874 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MitfQ08874 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MitfQ08874 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MitfQ08874 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MitfQ08874 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
MitfQ08874 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
MitfQ08874 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MitfQ08874 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MitfQ08874 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MitfQ08874 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MitfQ08874 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MitfQ08874 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MitfQ08874 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MitfQ08874 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MitfQ08874 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MitfQ08874 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MitfQ08874 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MitfQ08874 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MitfQ08874 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MitfQ08874 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MitfQ08874 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MitfQ08874 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MitfQ08874 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MitfQ08874 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MitfQ08874 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MitfQ08874 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MitfQ08874 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
MitfQ08874 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MitfQ08874 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MitfQ08874 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MitfQ08874 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MitfQ08874 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MitfQ08874 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MitfQ08874 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MitfQ08874 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MitfQ08874 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MitfQ08874 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MitfQ08874 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
MitfQ08874 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MitfQ08874 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MitfQ08874 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MitfQ08874 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MitfQ08874 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MitfQ08874 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MitfQ08874 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MitfQ08874 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MitfQ08874 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MitfQ08874 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MitfQ08874 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MitfQ08874 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MitfQ08874 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MitfQ08874 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MitfQ08874 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MitfQ08874 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MitfQ08874 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
MitfQ08874 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MitfQ08874 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MitfQ08874 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MitfQ08874 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MitfQ08874 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MitfQ08874 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MitfQ08874 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MitfQ08874 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MitfQ08874 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MitfQ08874 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MitfQ08874 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MitfQ08874 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MitfQ08874 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MitfQ08874 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MitfQ08874 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MitfQ08874 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MitfQ08874 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MitfQ08874 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MitfQ08874 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MitfQ08874 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MitfQ08874 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MitfQ08874 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MitfQ08874 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MitfQ08874 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
MitfQ08874 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MitfQ08874 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MitfQ08874 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MitfQ08874 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms