Protein–RNA interactions for Protein: Q07643

Col9a2, Collagen alpha-2(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a2Q07643 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Col9a2Q07643 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Col9a2Q07643 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Col9a2Q07643 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Col9a2Q07643 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Col9a2Q07643 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Col9a2Q07643 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Col9a2Q07643 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Col9a2Q07643 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Col9a2Q07643 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Col9a2Q07643 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Col9a2Q07643 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Col9a2Q07643 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Col9a2Q07643 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Col9a2Q07643 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Col9a2Q07643 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Col9a2Q07643 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Col9a2Q07643 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Col9a2Q07643 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Col9a2Q07643 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Col9a2Q07643 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Col9a2Q07643 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Col9a2Q07643 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Col9a2Q07643 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Col9a2Q07643 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Col9a2Q07643 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Col9a2Q07643 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Col9a2Q07643 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Col9a2Q07643 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Col9a2Q07643 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Col9a2Q07643 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Col9a2Q07643 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Col9a2Q07643 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Col9a2Q07643 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Col9a2Q07643 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Col9a2Q07643 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Col9a2Q07643 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Col9a2Q07643 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Col9a2Q07643 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Col9a2Q07643 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Col9a2Q07643 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Col9a2Q07643 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Col9a2Q07643 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Col9a2Q07643 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Col9a2Q07643 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Col9a2Q07643 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Col9a2Q07643 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Col9a2Q07643 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Col9a2Q07643 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Col9a2Q07643 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Col9a2Q07643 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Col9a2Q07643 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Col9a2Q07643 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Col9a2Q07643 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Col9a2Q07643 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Col9a2Q07643 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Col9a2Q07643 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Col9a2Q07643 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Col9a2Q07643 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Col9a2Q07643 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Col9a2Q07643 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Col9a2Q07643 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Col9a2Q07643 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Col9a2Q07643 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Col9a2Q07643 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Col9a2Q07643 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Col9a2Q07643 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Col9a2Q07643 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Col9a2Q07643 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Col9a2Q07643 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Col9a2Q07643 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Col9a2Q07643 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Col9a2Q07643 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Col9a2Q07643 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Col9a2Q07643 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Col9a2Q07643 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Col9a2Q07643 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Col9a2Q07643 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Col9a2Q07643 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Col9a2Q07643 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Col9a2Q07643 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Col9a2Q07643 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Col9a2Q07643 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Col9a2Q07643 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Col9a2Q07643 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Col9a2Q07643 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Col9a2Q07643 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Col9a2Q07643 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Col9a2Q07643 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Col9a2Q07643 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Col9a2Q07643 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Col9a2Q07643 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Col9a2Q07643 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Col9a2Q07643 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Col9a2Q07643 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Col9a2Q07643 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Col9a2Q07643 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Col9a2Q07643 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Col9a2Q07643 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Col9a2Q07643 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms