Protein–RNA interactions for Protein: Q06507

Atf4, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-4, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf4Q06507 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Atf4Q06507 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Atf4Q06507 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atf4Q06507 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atf4Q06507 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atf4Q06507 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atf4Q06507 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atf4Q06507 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atf4Q06507 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atf4Q06507 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atf4Q06507 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atf4Q06507 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atf4Q06507 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atf4Q06507 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atf4Q06507 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Atf4Q06507 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atf4Q06507 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atf4Q06507 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atf4Q06507 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atf4Q06507 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atf4Q06507 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atf4Q06507 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atf4Q06507 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atf4Q06507 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atf4Q06507 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atf4Q06507 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atf4Q06507 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atf4Q06507 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atf4Q06507 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atf4Q06507 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atf4Q06507 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atf4Q06507 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atf4Q06507 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atf4Q06507 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atf4Q06507 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atf4Q06507 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atf4Q06507 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atf4Q06507 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atf4Q06507 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Atf4Q06507 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Atf4Q06507 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atf4Q06507 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atf4Q06507 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atf4Q06507 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atf4Q06507 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atf4Q06507 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atf4Q06507 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atf4Q06507 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atf4Q06507 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atf4Q06507 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atf4Q06507 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atf4Q06507 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atf4Q06507 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atf4Q06507 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atf4Q06507 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atf4Q06507 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atf4Q06507 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atf4Q06507 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atf4Q06507 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atf4Q06507 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atf4Q06507 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atf4Q06507 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atf4Q06507 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atf4Q06507 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atf4Q06507 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atf4Q06507 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atf4Q06507 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atf4Q06507 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atf4Q06507 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atf4Q06507 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atf4Q06507 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atf4Q06507 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atf4Q06507 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atf4Q06507 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atf4Q06507 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atf4Q06507 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atf4Q06507 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atf4Q06507 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atf4Q06507 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atf4Q06507 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atf4Q06507 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atf4Q06507 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atf4Q06507 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atf4Q06507 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atf4Q06507 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atf4Q06507 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atf4Q06507 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atf4Q06507 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atf4Q06507 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atf4Q06507 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atf4Q06507 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atf4Q06507 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atf4Q06507 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atf4Q06507 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Atf4Q06507 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atf4Q06507 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atf4Q06507 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atf4Q06507 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atf4Q06507 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atf4Q06507 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms