Protein–RNA interactions for Protein: Q059Y8

Dcst1, E3 ubiquitin-protein ligase DCST1, mousemouse

Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dcst1Q059Y8 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dcst1Q059Y8 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dcst1Q059Y8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dcst1Q059Y8 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dcst1Q059Y8 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dcst1Q059Y8 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dcst1Q059Y8 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dcst1Q059Y8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dcst1Q059Y8 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Dcst1Q059Y8 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Dcst1Q059Y8 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Dcst1Q059Y8 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Dcst1Q059Y8 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dcst1Q059Y8 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dcst1Q059Y8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dcst1Q059Y8 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dcst1Q059Y8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dcst1Q059Y8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dcst1Q059Y8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dcst1Q059Y8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dcst1Q059Y8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dcst1Q059Y8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dcst1Q059Y8 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dcst1Q059Y8 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dcst1Q059Y8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dcst1Q059Y8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dcst1Q059Y8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dcst1Q059Y8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dcst1Q059Y8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dcst1Q059Y8 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dcst1Q059Y8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dcst1Q059Y8 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Dcst1Q059Y8 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Dcst1Q059Y8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Dcst1Q059Y8 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dcst1Q059Y8 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dcst1Q059Y8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dcst1Q059Y8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dcst1Q059Y8 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dcst1Q059Y8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dcst1Q059Y8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dcst1Q059Y8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dcst1Q059Y8 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Dcst1Q059Y8 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Dcst1Q059Y8 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Dcst1Q059Y8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Dcst1Q059Y8 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Dcst1Q059Y8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Dcst1Q059Y8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dcst1Q059Y8 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dcst1Q059Y8 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dcst1Q059Y8 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dcst1Q059Y8 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dcst1Q059Y8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Dcst1Q059Y8 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Dcst1Q059Y8 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Dcst1Q059Y8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Dcst1Q059Y8 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Dcst1Q059Y8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Dcst1Q059Y8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Dcst1Q059Y8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Dcst1Q059Y8 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Dcst1Q059Y8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Dcst1Q059Y8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Dcst1Q059Y8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Dcst1Q059Y8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Dcst1Q059Y8 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Dcst1Q059Y8 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Dcst1Q059Y8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Dcst1Q059Y8 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Dcst1Q059Y8 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Dcst1Q059Y8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Dcst1Q059Y8 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Dcst1Q059Y8 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Dcst1Q059Y8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Dcst1Q059Y8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Dcst1Q059Y8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Dcst1Q059Y8 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Dcst1Q059Y8 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Dcst1Q059Y8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Dcst1Q059Y8 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Dcst1Q059Y8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Dcst1Q059Y8 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Dcst1Q059Y8 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Dcst1Q059Y8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Dcst1Q059Y8 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Dcst1Q059Y8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Dcst1Q059Y8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Dcst1Q059Y8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Dcst1Q059Y8 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Dcst1Q059Y8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Dcst1Q059Y8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Dcst1Q059Y8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Dcst1Q059Y8 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Dcst1Q059Y8 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Dcst1Q059Y8 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Dcst1Q059Y8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Dcst1Q059Y8 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Dcst1Q059Y8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Dcst1Q059Y8 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms