Protein–RNA interactions for Protein: Q04207

Rela, Transcription factor p65, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RelaQ04207 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RelaQ04207 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RelaQ04207 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RelaQ04207 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RelaQ04207 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RelaQ04207 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RelaQ04207 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RelaQ04207 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RelaQ04207 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RelaQ04207 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RelaQ04207 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RelaQ04207 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RelaQ04207 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RelaQ04207 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RelaQ04207 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RelaQ04207 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RelaQ04207 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RelaQ04207 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RelaQ04207 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RelaQ04207 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RelaQ04207 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RelaQ04207 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RelaQ04207 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RelaQ04207 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RelaQ04207 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RelaQ04207 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RelaQ04207 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RelaQ04207 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RelaQ04207 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RelaQ04207 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RelaQ04207 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RelaQ04207 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RelaQ04207 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RelaQ04207 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RelaQ04207 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
RelaQ04207 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RelaQ04207 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RelaQ04207 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RelaQ04207 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RelaQ04207 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RelaQ04207 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RelaQ04207 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RelaQ04207 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RelaQ04207 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RelaQ04207 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RelaQ04207 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RelaQ04207 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RelaQ04207 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RelaQ04207 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RelaQ04207 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RelaQ04207 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RelaQ04207 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RelaQ04207 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RelaQ04207 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
RelaQ04207 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RelaQ04207 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RelaQ04207 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RelaQ04207 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RelaQ04207 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RelaQ04207 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RelaQ04207 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RelaQ04207 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RelaQ04207 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RelaQ04207 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RelaQ04207 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RelaQ04207 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RelaQ04207 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RelaQ04207 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RelaQ04207 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RelaQ04207 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RelaQ04207 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RelaQ04207 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RelaQ04207 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RelaQ04207 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RelaQ04207 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RelaQ04207 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RelaQ04207 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RelaQ04207 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RelaQ04207 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RelaQ04207 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RelaQ04207 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RelaQ04207 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RelaQ04207 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RelaQ04207 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RelaQ04207 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RelaQ04207 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RelaQ04207 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RelaQ04207 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RelaQ04207 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
RelaQ04207 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
RelaQ04207 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RelaQ04207 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RelaQ04207 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RelaQ04207 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RelaQ04207 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RelaQ04207 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RelaQ04207 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RelaQ04207 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RelaQ04207 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RelaQ04207 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms