Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NfiaQ02780 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NfiaQ02780 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NfiaQ02780 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NfiaQ02780 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NfiaQ02780 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
NfiaQ02780 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NfiaQ02780 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NfiaQ02780 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NfiaQ02780 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NfiaQ02780 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NfiaQ02780 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NfiaQ02780 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NfiaQ02780 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NfiaQ02780 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NfiaQ02780 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NfiaQ02780 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
NfiaQ02780 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NfiaQ02780 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NfiaQ02780 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NfiaQ02780 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NfiaQ02780 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NfiaQ02780 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NfiaQ02780 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NfiaQ02780 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
NfiaQ02780 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NfiaQ02780 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NfiaQ02780 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NfiaQ02780 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NfiaQ02780 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NfiaQ02780 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NfiaQ02780 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NfiaQ02780 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NfiaQ02780 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NfiaQ02780 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NfiaQ02780 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NfiaQ02780 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NfiaQ02780 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NfiaQ02780 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
NfiaQ02780 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NfiaQ02780 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NfiaQ02780 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NfiaQ02780 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NfiaQ02780 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NfiaQ02780 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NfiaQ02780 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
NfiaQ02780 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NfiaQ02780 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NfiaQ02780 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NfiaQ02780 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NfiaQ02780 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NfiaQ02780 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NfiaQ02780 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
NfiaQ02780 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NfiaQ02780 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NfiaQ02780 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NfiaQ02780 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NfiaQ02780 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NfiaQ02780 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NfiaQ02780 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NfiaQ02780 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NfiaQ02780 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NfiaQ02780 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NfiaQ02780 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NfiaQ02780 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NfiaQ02780 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NfiaQ02780 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NfiaQ02780 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NfiaQ02780 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NfiaQ02780 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NfiaQ02780 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NfiaQ02780 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NfiaQ02780 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
NfiaQ02780 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NfiaQ02780 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NfiaQ02780 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NfiaQ02780 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NfiaQ02780 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NfiaQ02780 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NfiaQ02780 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NfiaQ02780 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
NfiaQ02780 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NfiaQ02780 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NfiaQ02780 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NfiaQ02780 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NfiaQ02780 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NfiaQ02780 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NfiaQ02780 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NfiaQ02780 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NfiaQ02780 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NfiaQ02780 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NfiaQ02780 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NfiaQ02780 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NfiaQ02780 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
NfiaQ02780 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NfiaQ02780 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NfiaQ02780 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NfiaQ02780 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NfiaQ02780 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NfiaQ02780 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms