Protein–RNA interactions for Protein: Q02576

Nhlh1, Helix-loop-helix protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlh1Q02576 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nhlh1Q02576 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nhlh1Q02576 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nhlh1Q02576 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nhlh1Q02576 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nhlh1Q02576 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nhlh1Q02576 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nhlh1Q02576 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nhlh1Q02576 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nhlh1Q02576 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nhlh1Q02576 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nhlh1Q02576 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Nhlh1Q02576 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nhlh1Q02576 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Nhlh1Q02576 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nhlh1Q02576 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nhlh1Q02576 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Nhlh1Q02576 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Nhlh1Q02576 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nhlh1Q02576 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nhlh1Q02576 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Nhlh1Q02576 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nhlh1Q02576 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nhlh1Q02576 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nhlh1Q02576 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nhlh1Q02576 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nhlh1Q02576 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Nhlh1Q02576 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nhlh1Q02576 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nhlh1Q02576 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nhlh1Q02576 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nhlh1Q02576 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nhlh1Q02576 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nhlh1Q02576 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Nhlh1Q02576 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nhlh1Q02576 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nhlh1Q02576 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nhlh1Q02576 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nhlh1Q02576 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nhlh1Q02576 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nhlh1Q02576 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nhlh1Q02576 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nhlh1Q02576 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nhlh1Q02576 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nhlh1Q02576 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nhlh1Q02576 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nhlh1Q02576 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nhlh1Q02576 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nhlh1Q02576 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nhlh1Q02576 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Nhlh1Q02576 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nhlh1Q02576 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nhlh1Q02576 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nhlh1Q02576 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nhlh1Q02576 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Nhlh1Q02576 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nhlh1Q02576 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nhlh1Q02576 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nhlh1Q02576 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nhlh1Q02576 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nhlh1Q02576 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Nhlh1Q02576 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nhlh1Q02576 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nhlh1Q02576 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nhlh1Q02576 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nhlh1Q02576 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nhlh1Q02576 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nhlh1Q02576 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nhlh1Q02576 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nhlh1Q02576 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nhlh1Q02576 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nhlh1Q02576 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nhlh1Q02576 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nhlh1Q02576 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Nhlh1Q02576 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Nhlh1Q02576 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Nhlh1Q02576 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Nhlh1Q02576 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nhlh1Q02576 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nhlh1Q02576 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nhlh1Q02576 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nhlh1Q02576 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nhlh1Q02576 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nhlh1Q02576 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nhlh1Q02576 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Nhlh1Q02576 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nhlh1Q02576 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nhlh1Q02576 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nhlh1Q02576 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nhlh1Q02576 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nhlh1Q02576 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Nhlh1Q02576 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Nhlh1Q02576 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nhlh1Q02576 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Nhlh1Q02576 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nhlh1Q02576 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nhlh1Q02576 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Nhlh1Q02576 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nhlh1Q02576 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Nhlh1Q02576 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms