Protein–RNA interactions for Protein: Q01102

Selp, P-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelpQ01102 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SelpQ01102 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SelpQ01102 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SelpQ01102 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SelpQ01102 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SelpQ01102 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SelpQ01102 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SelpQ01102 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SelpQ01102 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SelpQ01102 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SelpQ01102 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SelpQ01102 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SelpQ01102 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
SelpQ01102 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SelpQ01102 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SelpQ01102 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
SelpQ01102 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SelpQ01102 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SelpQ01102 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SelpQ01102 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SelpQ01102 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SelpQ01102 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SelpQ01102 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SelpQ01102 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SelpQ01102 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SelpQ01102 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SelpQ01102 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SelpQ01102 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SelpQ01102 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SelpQ01102 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
SelpQ01102 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SelpQ01102 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SelpQ01102 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SelpQ01102 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SelpQ01102 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SelpQ01102 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SelpQ01102 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SelpQ01102 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SelpQ01102 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SelpQ01102 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SelpQ01102 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SelpQ01102 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
SelpQ01102 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SelpQ01102 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SelpQ01102 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SelpQ01102 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SelpQ01102 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SelpQ01102 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SelpQ01102 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SelpQ01102 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SelpQ01102 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SelpQ01102 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SelpQ01102 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SelpQ01102 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SelpQ01102 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SelpQ01102 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SelpQ01102 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SelpQ01102 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SelpQ01102 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SelpQ01102 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SelpQ01102 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
SelpQ01102 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SelpQ01102 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SelpQ01102 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
SelpQ01102 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SelpQ01102 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SelpQ01102 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
SelpQ01102 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
SelpQ01102 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SelpQ01102 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
SelpQ01102 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
SelpQ01102 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SelpQ01102 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SelpQ01102 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SelpQ01102 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SelpQ01102 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SelpQ01102 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SelpQ01102 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SelpQ01102 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
SelpQ01102 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
SelpQ01102 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SelpQ01102 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SelpQ01102 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
SelpQ01102 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
SelpQ01102 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
SelpQ01102 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SelpQ01102 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SelpQ01102 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
SelpQ01102 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SelpQ01102 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SelpQ01102 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SelpQ01102 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SelpQ01102 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SelpQ01102 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
SelpQ01102 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SelpQ01102 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SelpQ01102 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SelpQ01102 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SelpQ01102 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SelpQ01102 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms