Protein–RNA interactions for Protein: P97953

Vegfc, Vascular endothelial growth factor C, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfcP97953 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
VegfcP97953 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VegfcP97953 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VegfcP97953 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VegfcP97953 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VegfcP97953 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
VegfcP97953 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
VegfcP97953 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
VegfcP97953 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
VegfcP97953 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VegfcP97953 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
VegfcP97953 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
VegfcP97953 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VegfcP97953 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VegfcP97953 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VegfcP97953 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VegfcP97953 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VegfcP97953 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
VegfcP97953 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VegfcP97953 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
VegfcP97953 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
VegfcP97953 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
VegfcP97953 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VegfcP97953 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VegfcP97953 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VegfcP97953 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VegfcP97953 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VegfcP97953 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
VegfcP97953 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VegfcP97953 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VegfcP97953 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VegfcP97953 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
VegfcP97953 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VegfcP97953 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VegfcP97953 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VegfcP97953 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
VegfcP97953 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VegfcP97953 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VegfcP97953 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
VegfcP97953 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
VegfcP97953 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
VegfcP97953 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
VegfcP97953 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
VegfcP97953 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
VegfcP97953 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VegfcP97953 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
VegfcP97953 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
VegfcP97953 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VegfcP97953 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
VegfcP97953 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VegfcP97953 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
VegfcP97953 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VegfcP97953 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VegfcP97953 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VegfcP97953 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
VegfcP97953 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VegfcP97953 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VegfcP97953 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
VegfcP97953 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
VegfcP97953 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
VegfcP97953 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
VegfcP97953 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VegfcP97953 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VegfcP97953 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VegfcP97953 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
VegfcP97953 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
VegfcP97953 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VegfcP97953 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
VegfcP97953 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
VegfcP97953 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VegfcP97953 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VegfcP97953 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VegfcP97953 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VegfcP97953 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VegfcP97953 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
VegfcP97953 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VegfcP97953 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
VegfcP97953 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VegfcP97953 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
VegfcP97953 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
VegfcP97953 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
VegfcP97953 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
VegfcP97953 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
VegfcP97953 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VegfcP97953 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VegfcP97953 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
VegfcP97953 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VegfcP97953 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VegfcP97953 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VegfcP97953 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VegfcP97953 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VegfcP97953 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VegfcP97953 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VegfcP97953 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
VegfcP97953 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VegfcP97953 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VegfcP97953 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VegfcP97953 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VegfcP97953 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VegfcP97953 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms