Protein–RNA interactions for Protein: P97927

Lama4, Laminin subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,816 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lama4P97927 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Lama4P97927 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Lama4P97927 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Lama4P97927 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Lama4P97927 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
Lama4P97927 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Lama4P97927 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC30.26■■■□□ 2.44
Lama4P97927 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
Lama4P97927 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
Lama4P97927 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Lama4P97927 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Lama4P97927 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Lama4P97927 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Lama4P97927 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Lama4P97927 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Lama4P97927 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Lama4P97927 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
Lama4P97927 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Lama4P97927 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Lama4P97927 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Lama4P97927 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Lama4P97927 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Lama4P97927 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Lama4P97927 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Lama4P97927 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Lama4P97927 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Lama4P97927 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Lama4P97927 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Lama4P97927 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Lama4P97927 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
Lama4P97927 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Lama4P97927 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Lama4P97927 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Lama4P97927 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Lama4P97927 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Lama4P97927 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Lama4P97927 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Lama4P97927 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Lama4P97927 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Lama4P97927 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
Lama4P97927 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Lama4P97927 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Lama4P97927 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Lama4P97927 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Lama4P97927 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Lama4P97927 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Lama4P97927 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Lama4P97927 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Lama4P97927 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Lama4P97927 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Lama4P97927 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Lama4P97927 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
Lama4P97927 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Lama4P97927 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Lama4P97927 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Lama4P97927 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Lama4P97927 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Lama4P97927 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Lama4P97927 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Lama4P97927 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Lama4P97927 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Lama4P97927 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Lama4P97927 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Lama4P97927 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Lama4P97927 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
Lama4P97927 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Lama4P97927 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
Lama4P97927 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC29.95■■■□□ 2.39
Lama4P97927 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Lama4P97927 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Lama4P97927 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Lama4P97927 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Lama4P97927 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Lama4P97927 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Lama4P97927 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Lama4P97927 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Lama4P97927 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Lama4P97927 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Lama4P97927 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Lama4P97927 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Lama4P97927 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Lama4P97927 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Lama4P97927 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
Lama4P97927 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Lama4P97927 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Lama4P97927 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Lama4P97927 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Lama4P97927 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Lama4P97927 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Lama4P97927 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Lama4P97927 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Lama4P97927 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Lama4P97927 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Lama4P97927 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
Lama4P97927 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Lama4P97927 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Lama4P97927 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Lama4P97927 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Lama4P97927 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Lama4P97927 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms