Protein–RNA interactions for Protein: P97473

Tarbp2, RISC-loading complex subunit TARBP2, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tarbp2P97473 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Tarbp2P97473 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Tarbp2P97473 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tarbp2P97473 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Tarbp2P97473 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Tarbp2P97473 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Tarbp2P97473 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Tarbp2P97473 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Tarbp2P97473 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Tarbp2P97473 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Tarbp2P97473 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Tarbp2P97473 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Tarbp2P97473 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
Tarbp2P97473 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Tarbp2P97473 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Tarbp2P97473 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Tarbp2P97473 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Tarbp2P97473 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Tarbp2P97473 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Tarbp2P97473 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Tarbp2P97473 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Tarbp2P97473 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Tarbp2P97473 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Tarbp2P97473 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Tarbp2P97473 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Tarbp2P97473 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Tarbp2P97473 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Tarbp2P97473 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Tarbp2P97473 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Tarbp2P97473 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Tarbp2P97473 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Tarbp2P97473 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Tarbp2P97473 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tarbp2P97473 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tarbp2P97473 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Tarbp2P97473 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Tarbp2P97473 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Tarbp2P97473 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Tarbp2P97473 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Tarbp2P97473 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Tarbp2P97473 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Tarbp2P97473 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Tarbp2P97473 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Tarbp2P97473 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Tarbp2P97473 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Tarbp2P97473 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Tarbp2P97473 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Tarbp2P97473 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Tarbp2P97473 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Tarbp2P97473 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Tarbp2P97473 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Tarbp2P97473 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Tarbp2P97473 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Tarbp2P97473 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Tarbp2P97473 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Tarbp2P97473 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Tarbp2P97473 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Tarbp2P97473 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Tarbp2P97473 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Tarbp2P97473 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Tarbp2P97473 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Tarbp2P97473 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Tarbp2P97473 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Tarbp2P97473 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Tarbp2P97473 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Tarbp2P97473 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Tarbp2P97473 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Tarbp2P97473 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Tarbp2P97473 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Tarbp2P97473 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Tarbp2P97473 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Tarbp2P97473 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Tarbp2P97473 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Tarbp2P97473 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Tarbp2P97473 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Tarbp2P97473 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Tarbp2P97473 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Tarbp2P97473 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Tarbp2P97473 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Tarbp2P97473 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Tarbp2P97473 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Tarbp2P97473 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Tarbp2P97473 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tarbp2P97473 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tarbp2P97473 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Tarbp2P97473 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Tarbp2P97473 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Tarbp2P97473 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tarbp2P97473 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tarbp2P97473 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tarbp2P97473 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tarbp2P97473 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Tarbp2P97473 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tarbp2P97473 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tarbp2P97473 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Tarbp2P97473 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Tarbp2P97473 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Tarbp2P97473 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Tarbp2P97473 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Tarbp2P97473 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms