Protein–RNA interactions for Protein: P97438

Kcnk2, Potassium channel subfamily K member 2, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnk2P97438 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kcnk2P97438 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kcnk2P97438 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kcnk2P97438 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kcnk2P97438 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kcnk2P97438 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kcnk2P97438 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Kcnk2P97438 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kcnk2P97438 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kcnk2P97438 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kcnk2P97438 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kcnk2P97438 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Kcnk2P97438 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kcnk2P97438 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kcnk2P97438 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kcnk2P97438 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kcnk2P97438 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kcnk2P97438 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kcnk2P97438 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kcnk2P97438 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kcnk2P97438 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Kcnk2P97438 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kcnk2P97438 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kcnk2P97438 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kcnk2P97438 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kcnk2P97438 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Kcnk2P97438 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kcnk2P97438 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kcnk2P97438 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kcnk2P97438 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kcnk2P97438 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kcnk2P97438 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kcnk2P97438 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kcnk2P97438 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kcnk2P97438 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kcnk2P97438 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kcnk2P97438 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kcnk2P97438 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kcnk2P97438 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kcnk2P97438 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kcnk2P97438 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kcnk2P97438 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kcnk2P97438 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Kcnk2P97438 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Kcnk2P97438 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Kcnk2P97438 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kcnk2P97438 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kcnk2P97438 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kcnk2P97438 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kcnk2P97438 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kcnk2P97438 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kcnk2P97438 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kcnk2P97438 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kcnk2P97438 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kcnk2P97438 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kcnk2P97438 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kcnk2P97438 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Kcnk2P97438 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Kcnk2P97438 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Kcnk2P97438 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
Kcnk2P97438 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kcnk2P97438 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kcnk2P97438 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kcnk2P97438 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kcnk2P97438 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kcnk2P97438 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kcnk2P97438 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kcnk2P97438 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kcnk2P97438 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kcnk2P97438 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kcnk2P97438 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kcnk2P97438 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kcnk2P97438 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kcnk2P97438 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kcnk2P97438 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kcnk2P97438 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kcnk2P97438 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kcnk2P97438 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kcnk2P97438 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kcnk2P97438 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kcnk2P97438 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kcnk2P97438 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kcnk2P97438 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kcnk2P97438 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kcnk2P97438 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kcnk2P97438 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kcnk2P97438 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kcnk2P97438 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kcnk2P97438 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kcnk2P97438 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kcnk2P97438 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kcnk2P97438 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Kcnk2P97438 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Kcnk2P97438 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kcnk2P97438 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kcnk2P97438 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kcnk2P97438 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kcnk2P97438 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kcnk2P97438 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kcnk2P97438 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms