Protein–RNA interactions for Protein: P97358

Taf1b, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1bP97358 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Taf1bP97358 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Taf1bP97358 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Taf1bP97358 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Taf1bP97358 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Taf1bP97358 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Taf1bP97358 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Taf1bP97358 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Taf1bP97358 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Taf1bP97358 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Taf1bP97358 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Taf1bP97358 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Taf1bP97358 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Taf1bP97358 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Taf1bP97358 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Taf1bP97358 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Taf1bP97358 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Taf1bP97358 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Taf1bP97358 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Taf1bP97358 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Taf1bP97358 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Taf1bP97358 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Taf1bP97358 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Taf1bP97358 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Taf1bP97358 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Taf1bP97358 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Taf1bP97358 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Taf1bP97358 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Taf1bP97358 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Taf1bP97358 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Taf1bP97358 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Taf1bP97358 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Taf1bP97358 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Taf1bP97358 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Taf1bP97358 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Taf1bP97358 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Taf1bP97358 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Taf1bP97358 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Taf1bP97358 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Taf1bP97358 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Taf1bP97358 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Taf1bP97358 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Taf1bP97358 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Taf1bP97358 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Taf1bP97358 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Taf1bP97358 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Taf1bP97358 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Taf1bP97358 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Taf1bP97358 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Taf1bP97358 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Taf1bP97358 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Taf1bP97358 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Taf1bP97358 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Taf1bP97358 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Taf1bP97358 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Taf1bP97358 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Taf1bP97358 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Taf1bP97358 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Taf1bP97358 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Taf1bP97358 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Taf1bP97358 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Taf1bP97358 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Taf1bP97358 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Taf1bP97358 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Taf1bP97358 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Taf1bP97358 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Taf1bP97358 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Taf1bP97358 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Taf1bP97358 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Taf1bP97358 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Taf1bP97358 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Taf1bP97358 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Taf1bP97358 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Taf1bP97358 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Taf1bP97358 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Taf1bP97358 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Taf1bP97358 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Taf1bP97358 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Taf1bP97358 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Taf1bP97358 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Taf1bP97358 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Taf1bP97358 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Taf1bP97358 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Taf1bP97358 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Taf1bP97358 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Taf1bP97358 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Taf1bP97358 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Taf1bP97358 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Taf1bP97358 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Taf1bP97358 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Taf1bP97358 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Taf1bP97358 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Taf1bP97358 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Taf1bP97358 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Taf1bP97358 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Taf1bP97358 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Taf1bP97358 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Taf1bP97358 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.58■■□□□ 1.84
Taf1bP97358 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Taf1bP97358 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms