Protein–RNA interactions for Protein: P97299

Sfrp2, Secreted frizzled-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfrp2P97299 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sfrp2P97299 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sfrp2P97299 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sfrp2P97299 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sfrp2P97299 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sfrp2P97299 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sfrp2P97299 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sfrp2P97299 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sfrp2P97299 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sfrp2P97299 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sfrp2P97299 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sfrp2P97299 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sfrp2P97299 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Sfrp2P97299 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sfrp2P97299 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sfrp2P97299 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sfrp2P97299 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sfrp2P97299 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sfrp2P97299 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sfrp2P97299 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sfrp2P97299 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sfrp2P97299 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sfrp2P97299 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sfrp2P97299 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sfrp2P97299 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Sfrp2P97299 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sfrp2P97299 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sfrp2P97299 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sfrp2P97299 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sfrp2P97299 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Sfrp2P97299 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Sfrp2P97299 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sfrp2P97299 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sfrp2P97299 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sfrp2P97299 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sfrp2P97299 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sfrp2P97299 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sfrp2P97299 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sfrp2P97299 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sfrp2P97299 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sfrp2P97299 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sfrp2P97299 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sfrp2P97299 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Sfrp2P97299 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sfrp2P97299 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sfrp2P97299 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sfrp2P97299 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sfrp2P97299 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sfrp2P97299 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sfrp2P97299 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sfrp2P97299 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Sfrp2P97299 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sfrp2P97299 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sfrp2P97299 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sfrp2P97299 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sfrp2P97299 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sfrp2P97299 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sfrp2P97299 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Sfrp2P97299 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sfrp2P97299 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sfrp2P97299 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sfrp2P97299 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sfrp2P97299 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sfrp2P97299 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sfrp2P97299 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sfrp2P97299 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sfrp2P97299 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sfrp2P97299 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sfrp2P97299 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sfrp2P97299 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sfrp2P97299 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sfrp2P97299 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sfrp2P97299 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sfrp2P97299 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sfrp2P97299 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sfrp2P97299 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sfrp2P97299 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sfrp2P97299 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sfrp2P97299 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sfrp2P97299 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sfrp2P97299 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sfrp2P97299 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sfrp2P97299 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sfrp2P97299 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sfrp2P97299 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sfrp2P97299 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sfrp2P97299 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sfrp2P97299 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sfrp2P97299 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sfrp2P97299 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sfrp2P97299 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sfrp2P97299 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sfrp2P97299 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sfrp2P97299 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sfrp2P97299 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sfrp2P97299 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sfrp2P97299 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sfrp2P97299 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Sfrp2P97299 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sfrp2P97299 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms