Protein–RNA interactions for Protein: P97299

Sfrp2, Secreted frizzled-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfrp2P97299 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sfrp2P97299 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sfrp2P97299 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sfrp2P97299 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sfrp2P97299 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sfrp2P97299 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sfrp2P97299 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sfrp2P97299 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sfrp2P97299 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sfrp2P97299 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sfrp2P97299 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sfrp2P97299 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sfrp2P97299 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Sfrp2P97299 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sfrp2P97299 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sfrp2P97299 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sfrp2P97299 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sfrp2P97299 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sfrp2P97299 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sfrp2P97299 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sfrp2P97299 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sfrp2P97299 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sfrp2P97299 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sfrp2P97299 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sfrp2P97299 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Sfrp2P97299 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sfrp2P97299 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sfrp2P97299 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sfrp2P97299 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sfrp2P97299 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Sfrp2P97299 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Sfrp2P97299 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sfrp2P97299 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sfrp2P97299 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sfrp2P97299 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sfrp2P97299 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sfrp2P97299 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sfrp2P97299 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sfrp2P97299 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sfrp2P97299 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sfrp2P97299 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sfrp2P97299 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sfrp2P97299 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Sfrp2P97299 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sfrp2P97299 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sfrp2P97299 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sfrp2P97299 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sfrp2P97299 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sfrp2P97299 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sfrp2P97299 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sfrp2P97299 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Sfrp2P97299 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sfrp2P97299 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sfrp2P97299 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sfrp2P97299 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sfrp2P97299 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sfrp2P97299 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sfrp2P97299 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Sfrp2P97299 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sfrp2P97299 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sfrp2P97299 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sfrp2P97299 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sfrp2P97299 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sfrp2P97299 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sfrp2P97299 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sfrp2P97299 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sfrp2P97299 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sfrp2P97299 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sfrp2P97299 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sfrp2P97299 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sfrp2P97299 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sfrp2P97299 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sfrp2P97299 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sfrp2P97299 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sfrp2P97299 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sfrp2P97299 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sfrp2P97299 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sfrp2P97299 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sfrp2P97299 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sfrp2P97299 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sfrp2P97299 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sfrp2P97299 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sfrp2P97299 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sfrp2P97299 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sfrp2P97299 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sfrp2P97299 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sfrp2P97299 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sfrp2P97299 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sfrp2P97299 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sfrp2P97299 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sfrp2P97299 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sfrp2P97299 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sfrp2P97299 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sfrp2P97299 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sfrp2P97299 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sfrp2P97299 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sfrp2P97299 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sfrp2P97299 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Sfrp2P97299 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sfrp2P97299 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms