Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Otx2P80206 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Otx2P80206 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Otx2P80206 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Otx2P80206 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Otx2P80206 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Otx2P80206 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Otx2P80206 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Otx2P80206 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Otx2P80206 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Otx2P80206 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Otx2P80206 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Otx2P80206 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Otx2P80206 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Otx2P80206 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Otx2P80206 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Otx2P80206 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Otx2P80206 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Otx2P80206 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Otx2P80206 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Otx2P80206 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Otx2P80206 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Otx2P80206 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Otx2P80206 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Otx2P80206 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Otx2P80206 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Otx2P80206 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Otx2P80206 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Otx2P80206 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Otx2P80206 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Otx2P80206 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Otx2P80206 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Otx2P80206 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Otx2P80206 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Otx2P80206 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Otx2P80206 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Otx2P80206 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Otx2P80206 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Otx2P80206 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Otx2P80206 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Otx2P80206 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Otx2P80206 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Otx2P80206 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Otx2P80206 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Otx2P80206 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Otx2P80206 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Otx2P80206 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Otx2P80206 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Otx2P80206 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Otx2P80206 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Otx2P80206 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Otx2P80206 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Otx2P80206 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Otx2P80206 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Otx2P80206 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Otx2P80206 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Otx2P80206 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Otx2P80206 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Otx2P80206 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Otx2P80206 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Otx2P80206 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Otx2P80206 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Otx2P80206 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Otx2P80206 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Otx2P80206 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Otx2P80206 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Otx2P80206 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Otx2P80206 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Otx2P80206 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Otx2P80206 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Otx2P80206 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Otx2P80206 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Otx2P80206 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Otx2P80206 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Otx2P80206 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Otx2P80206 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Otx2P80206 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Otx2P80206 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Otx2P80206 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Otx2P80206 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Otx2P80206 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Otx2P80206 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Otx2P80206 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Otx2P80206 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Otx2P80206 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Otx2P80206 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Otx2P80206 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Otx2P80206 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Otx2P80206 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Otx2P80206 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Otx2P80206 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Otx2P80206 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Otx2P80206 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Otx2P80206 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Otx2P80206 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Otx2P80206 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Otx2P80206 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Otx2P80206 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Otx2P80206 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Otx2P80206 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms