Protein–RNA interactions for Protein: P70255

Nfic, Nuclear factor 1 C-type, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NficP70255 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NficP70255 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NficP70255 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NficP70255 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NficP70255 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NficP70255 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NficP70255 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NficP70255 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NficP70255 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NficP70255 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NficP70255 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NficP70255 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NficP70255 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NficP70255 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NficP70255 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NficP70255 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NficP70255 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NficP70255 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NficP70255 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NficP70255 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NficP70255 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NficP70255 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NficP70255 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NficP70255 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NficP70255 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NficP70255 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NficP70255 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NficP70255 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NficP70255 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NficP70255 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NficP70255 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NficP70255 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NficP70255 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NficP70255 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NficP70255 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NficP70255 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NficP70255 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NficP70255 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NficP70255 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NficP70255 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NficP70255 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NficP70255 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NficP70255 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NficP70255 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NficP70255 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NficP70255 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NficP70255 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NficP70255 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NficP70255 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NficP70255 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NficP70255 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NficP70255 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NficP70255 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NficP70255 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NficP70255 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NficP70255 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NficP70255 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NficP70255 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NficP70255 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NficP70255 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NficP70255 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NficP70255 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NficP70255 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NficP70255 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NficP70255 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NficP70255 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NficP70255 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NficP70255 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NficP70255 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NficP70255 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NficP70255 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NficP70255 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NficP70255 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NficP70255 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NficP70255 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NficP70255 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NficP70255 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NficP70255 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NficP70255 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NficP70255 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NficP70255 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NficP70255 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NficP70255 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NficP70255 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NficP70255 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NficP70255 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NficP70255 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NficP70255 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NficP70255 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NficP70255 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NficP70255 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NficP70255 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NficP70255 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NficP70255 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NficP70255 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NficP70255 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NficP70255 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NficP70255 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NficP70255 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NficP70255 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.3 ms